Missing coverage evidence...
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CTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTATT  >  minE/236213‑236274 |                                                              cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAatat                         >  1:652879/1‑39 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGttt          >  1:223671/1‑54 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:678462/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:222343/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:241991/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:244363/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:284347/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:328142/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:479040/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:534138/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:559675/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:580362/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:21774/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:701946/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:710420/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:759084/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:765333/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:766744/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:797934/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:81518/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:822794/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:896336/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:94861/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1504635/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:111051/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1111221/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:112726/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1181933/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1239091/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1242127/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:12441/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1262517/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1413650/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1413916/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1417165/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1048431/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1504909/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1512644/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:157418/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1648116/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1675688/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1772043/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1810251/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1855478/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAtt  >  1:1861795/1‑62 (MQ=255) cTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTAt   >  1:297276/1‑61 (MQ=255) cTGCGCGGAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAata                          >  1:1767679/1‑38 (MQ=255) |                                                              CTGCGCGTAATACGATCTTTCTTGAGCCGTCGCGAATATTGCCTCCACTGGTTTCCTCTATT  >  minE/236213‑236274

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑