Missing coverage evidence...
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ACTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGT  >  minE/2520135‑2520187 |                                                     acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:647976/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:242373/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:244552/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:311949/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:318070/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:381775/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:420005/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:439346/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:445016/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:463995/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:465490/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1842316/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:682942/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:701138/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:702876/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:785393/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:788664/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:909330/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:936367/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:94161/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:985293/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:999833/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1471538/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1103475/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1161951/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1209862/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1217078/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1346177/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1355467/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1364459/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:142871/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1439912/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1458008/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1072169/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1494645/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1568454/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1640257/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:165654/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:168388/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1691342/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1706167/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1716244/53‑1 (MQ=255) acTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGt  <  1:1801873/53‑1 (MQ=255) |                                                     ACTTTTTGCGCAAAGTTGTTGCGTTTTGCGTAGCTGCTTCCGCATTTGCCTGT  >  minE/2520135‑2520187

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑