Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2539562	2539704	143	15 [0]	[0] 15	rfaJ	UDP‑D‑glucose:(galactosyl)lipopolysaccharide glucosyltransferase

AGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAG  >  minE/2539705‑2539766 |                                                              aGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:1073489/62‑1 (MQ=255) aGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:1330780/62‑1 (MQ=255) aGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:1506352/62‑1 (MQ=255) aGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:1520341/62‑1 (MQ=255) aGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:1522096/62‑1 (MQ=255) aGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:1611424/62‑1 (MQ=255) aGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:1661917/62‑1 (MQ=255) aGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:1774271/62‑1 (MQ=255) aGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:1822948/62‑1 (MQ=255) aGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:1867756/62‑1 (MQ=255) aGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:266072/62‑1 (MQ=255) aGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:632095/62‑1 (MQ=255) aGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:768478/62‑1 (MQ=255) aGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:969063/62‑1 (MQ=255) aGCGTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAg  <  1:897828/62‑1 (MQ=255) |                                                              AGCTTGCAGAGCAAAACCAATTAAGAATCACGTTATATAGAATTAACACTGATAAGCTCCAG  >  minE/2539705‑2539766

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑