Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2585211	2585234	24	62 [0]	[0] 66	mdtF	multidrug transporter, RpoS‑dependent

TCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAGAC  >  minE/2585235‑2585296 |                                                              tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACcgc                       >  1:908542/1‑41 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAAGGGGAAgac  >  1:767758/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:295423/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:498650/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:438346/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:437993/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:430616/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:364276/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:357376/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:295979/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:548911/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:276238/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:246951/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:191194/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1833316/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1804676/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1020065/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:517915/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1794683/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:560165/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:567760/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:676101/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:712500/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:748471/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:777585/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:798339/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:815320/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:911159/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:912863/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:915180/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:932520/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:958288/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1467326/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1075088/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1105883/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1109502/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1164583/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1172428/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1183971/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1200927/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1202185/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1212142/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1333086/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1358418/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1377517/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1425200/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1466154/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:176676/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1689831/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1755006/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1749181/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1735359/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1733819/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:17104/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1690966/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1500578/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1657751/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1650354/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1610640/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1575581/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1566636/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1520923/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAgac  >  1:1514196/1‑62 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAga   >  1:688440/1‑61 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAga   >  1:1892949/1‑61 (MQ=255) tCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAga   >  1:1086571/1‑61 (MQ=255) |                                                              TCCATATCAAAACCTGACGCGGTACCCAGTTCAGCCACCGCGGGTAAGTTGAACGGGAAGAC  >  minE/2585235‑2585296

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑