Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2587919 2587927 9 10 [0] [0] 182 mdtE multidrug resistance efflux transporter

Only 100 of 182 total aligned reads displayed.

CGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCTT  >  minE/2587928‑2587989
|                                                             
cGTACTCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:907512/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGTCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:820158/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGTTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1831848/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGTAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1389371/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:252036/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:500304/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:496187/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:481151/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:478934/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:455849/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:420612/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:397173/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:359615/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:342205/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:317996/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:287229/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:258984/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:550121/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1873419/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1848509/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1844801/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1835582/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1832646/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1813559/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:17979/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1787503/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1772934/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:775497/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:972729/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:966571/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:954256/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:935146/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:920228/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:917768/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:910191/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:863619/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:826333/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:81815/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:796891/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:536579/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:752700/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:736119/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:696107/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:683548/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:654482/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:618175/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:595905/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:595822/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:5656/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1772526/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1190177/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1013719/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1417551/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1376772/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1365042/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1351121/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1344993/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1311972/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:130607/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1302587/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1286513/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1263137/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:120751/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1443102/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:118773/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1155467/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1139602/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1116615/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1102445/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1093666/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1092454/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1062097/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1042380/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1027514/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1023404/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:155790/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1768957/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1763458/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1738708/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1719605/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1700420/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1683137/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1665563/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1643761/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1634397/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1592788/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1580545/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1578669/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1449031/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1548682/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1542193/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:152895/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:152531/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1519527/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1503094/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1489917/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1475171/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1474692/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGACGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:681057/62‑1 (MQ=255)
cGTAATCGGCGAGGGGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCtt  <  1:1534619/62‑1 (MQ=255)
|                                                             
CGTAATCGGCGAGGTGACATTCGCGTATTGCAGATTGATCGTCGCCTGTTCAACAGCCGCTT  >  minE/2587928‑2587989

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑