Missing coverage evidence...
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CGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCTGGTGG  >  minE/2605028‑2605089 |                                                              cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCTGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:218030/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCa               >  1:330457/1‑49 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtgg  >  1:440860/1‑62 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:1152385/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:988817/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:975080/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:930840/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:913420/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:893081/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:865986/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:788098/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:771283/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:765678/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:730173/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:682179/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:327977/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:217076/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:192803/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:1715177/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:1633853/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:1531529/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:1361773/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:1322293/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:1291258/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:1092039/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggt    >  1:313299/1‑60 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATAAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:385713/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGGTGTTGACCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:722521/1‑61 (MQ=255) cGTGAACGATGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCtggtg   >  1:354699/1‑61 (MQ=255) |                                                              CGTGAACGGTGTTGATCAGCTGACGTGCGGAAGACATCAGTTTGCTCCAGAAGTCCTGGTGG  >  minE/2605028‑2605089

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑