Missing coverage evidence...
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TACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGC  >  minE/2631044‑2631105 |                                                              tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:759527/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1726113/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1756540/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1791126/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1844957/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:242483/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:424852/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:531668/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:710594/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1663290/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:799371/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:801802/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:805922/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:845815/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:874721/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:941285/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:959076/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:979900/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1457444/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1069070/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1086890/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1119330/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1165078/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1229885/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1253299/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1376569/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1449546/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1039826/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1511065/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1516082/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1559109/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1561314/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1575550/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1593358/62‑1 (MQ=255) tACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGc  <  1:1614131/62‑1 (MQ=255) |                                                              TACGGCTGGAGTATCGAACGGGTGGCTTACCGCCCGGTGCGTAACTCTAAGCGCCTGATTGC  >  minE/2631044‑2631105

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑