Missing coverage evidence...
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ATTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGTT  >  minE/2650880‑2650941 |                                                              aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTAt                            >  1:362054/1‑36 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGt                       >  1:1381137/1‑41 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCccgccg       >  1:1664475/1‑57 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:578457/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:352096/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:371626/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:381496/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:437138/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:451536/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:482094/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:545723/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:547905/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:301706/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:65922/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:671282/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:701118/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:773228/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:832360/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:851587/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:888827/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:961323/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:258927/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:1044612/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:1121513/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:1124713/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:1242035/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:1301222/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:1319445/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:1395050/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:145697/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:1465316/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:171677/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:1774580/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:1872940/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:202126/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:1042602/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGt   >  1:604222/1‑61 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGt   >  1:709930/1‑61 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGt   >  1:1206619/1‑61 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGt   >  1:110962/1‑61 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTGATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGtt  >  1:1732882/1‑62 (MQ=255) aTTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCAGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCccgcc        >  1:1382011/1‑56 (MQ=255) |                                                              ATTGCTGAACCGTGGGATATCGCTCCTGGTGGTTATCAGGTGGGAAATTTCCCGCCGCTGTT  >  minE/2650880‑2650941

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑