Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2663146	2663358	213	26 [0]	[0] 93	rtcB	conserved hypothetical protein

CGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATGG  >  minE/2663359‑2663418 |                                                            cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTTGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:102609/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTGAATgg  <  1:1614462/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:294163/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:553743/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:453855/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:438326/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:420218/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:414029/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:398657/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:396471/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:367609/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:356230/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:329418/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:309330/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:591655/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:293207/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:269254/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:257522/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:228945/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:228938/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:228504/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:217165/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1876208/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:187534/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1869291/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:874098/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:989802/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:983793/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:963913/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:955121/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:953875/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:951157/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:915893/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:898061/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:894868/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:894626/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:878412/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1858520/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:806880/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:670964/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:658951/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:639568/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:638179/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:635975/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:621030/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:616977/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:61656/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:598593/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1200837/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1496837/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1444346/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1410273/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1407397/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1397153/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1394683/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1262303/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1261364/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1249978/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1203379/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:120174/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1544662/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1173649/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:115360/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1106676/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1092232/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1091843/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:107699/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1055468/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1045616/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1018491/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1009406/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1687049/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1001640/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1820435/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1802004/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1753637/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1752416/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1730908/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1730359/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1729766/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1701427/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1697570/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1862943/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1614609/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1613961/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:161005/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1603418/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1588142/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1586876/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1572633/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:157252/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1570347/60‑1 (MQ=255) cGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATgg  <  1:1555371/60‑1 (MQ=255) |                                                            CGTTGTAAACGTGATAAAGGTGCCTGGGAAAATCCACCTGTTAACGTCGATGCTAAATGG  >  minE/2663359‑2663418

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑