Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1028628 1041937 13310 204 [0] [0] 210 [malX]–[ydgR] [malX],malY,add,ydgJ,blr,ydgT,ydgK,rsxA,rsxB,rsxC,rsxD,rsxG,rsxE,nth,[ydgR]

Only 100 of 204 total aligned reads displayed.

GTTATCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTG  >  minE/1028570‑1028627
                                                         |
  tATCGGGCCACAAGTCCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:301395/56‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:290480/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:31756/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:315110/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:314613/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:306182/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:302508/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:300573/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:299543/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:295055/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:29231/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:290657/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:31988/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:290299/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:288375/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:287334/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:28604/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:284217/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:27885/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:277929/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:27384/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:270150/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:1002/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:249917/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:68166/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:94058/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:93731/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:92615/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:92076/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:87838/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:84907/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:83876/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:81716/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:80735/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:75798/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:72327/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:260180/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:64830/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:63748/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:60061/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:53679/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:50724/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:49658/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:4927/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:47017/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:43753/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:39823/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:38077/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:139603/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:177944/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:176363/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:249009/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:166419/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:164053/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:163327/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:159226/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:153590/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:151715/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:148831/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:148417/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:170574/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:136093/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:132587/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:13010/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:124109/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:122978/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:120740/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:117500/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:1156/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:107502/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:105433/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:101217/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:228270/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:247183/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:245530/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:24331/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:242028/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:239448/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:238407/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:237760/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:235625/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:232579/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:230203/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:182266/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:226864/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:224532/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:217456/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:21486/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:202810/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:195666/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:190209/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:186882/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGGCTGATGCATACTg  <  1:272173/55‑1 (MQ=255)
   aTCGGGCCACAAGTTCAGTCACTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:309585/55‑1 (MQ=255)
    tCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:147081/54‑1 (MQ=255)
    tCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:215437/54‑1 (MQ=255)
    tCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:78455/54‑1 (MQ=255)
    tCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:125569/54‑1 (MQ=255)
                     tcagtAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:150250/37‑1 (MQ=255)
                       agtAAAAGATGATATGGCCGGTCTGATGCATACTg  <  1:41526/35‑1 (MQ=255)
                                                         |
GTTATCGGGCCACAAGTTCAGTCAGTAAAAGATGAAATGGCCGGTCTGATGCATACTG  >  minE/1028570‑1028627

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: