Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2521978	2536529	14552	57 [0]	[1] 156	[ligB]–[rfaS]	[ligB],yicG,dinD,yicC,rph,pyrE,ttk,dut,dfp,yicR,rpmB,rpmG,mutM,coaD,kdtA,rfaQ,rfaG,rfaP,[rfaS]

AGGAAAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGTTTT  >  minE/2521916‑2521977                                                              | ttgaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:62102/60‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:302984/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:258698/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:104570/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:265371/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:272462/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:27286/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:276736/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:278360/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:28138/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:288141/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:294598/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:295976/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:297376/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:260466/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:39434/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:43553/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:50421/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:52271/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:52418/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:54438/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:67047/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:70822/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:89332/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:92822/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:95927/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:158759/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:111639/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:112490/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:115078/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:120747/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:128118/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:131554/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:141513/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:152414/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:158633/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:251585/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:168446/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:248267/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:18930/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:243946/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:237589/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:228104/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:203700/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:187281/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:21069/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:220082/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCGGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:300552/62‑1 (MQ=255) aggaaAATGCGCAAATCAAGAACCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:47862/62‑1 (MQ=255)  ggaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:143885/61‑1 (MQ=255)   gaaAATGCTCAAATCAAGAAGCTTGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:315662/60‑1 (MQ=255)   gaaAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:308869/60‑1 (MQ=255)             aaaTCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:247479/50‑1 (MQ=255)             aaaTCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:163870/50‑1 (MQ=255)                 cAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:119786/46‑1 (MQ=255)                        cTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:283451/39‑1 (MQ=255)                          gggCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGtttt  <  1:112895/37‑1 (MQ=255)                                                              | AGGAAAATGCGCAAATCAAGAAGCTGGGCAGTTGGCTGGCTGCCCAGCAGATCACAGGTTTT  >  minE/2521916‑2521977

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑