Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA minE 1,781,043 C→T L157L (CTC→CTT)  ypjD → predicted inner membrane protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE1,781,0430CT100.0% 1863.3 / NA 693L157L (CTC→CTT) ypjDpredicted inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (693/0);  total (693/0)

Only 100 of 693 total aligned reads displayed.

TCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTACGCGCTGCAACTGGCGTGGATT  >  minE/1781038‑1781100
     |                                                         
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     |                                                         
TCGCTCTTTTCCTATGCCACGCTAATTATCGCCGCCCTGTACGCGCTGCAACTGGCGTGGATT  >  minE/1781038‑1781100

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑