| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 1,754,163 | G→A | 9.8% | A509T (GCG→ACG) | yfiQ → | fused predicted acyl‑CoA synthetase NAD(P)‑binding subunit and ATP‑binding subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 1,754,163 | 0 | G | A | 9.8% | 188.3 / 8.8 | 61 | A509T (GCG→ACG) | yfiQ | fused predicted acyl‑CoA synthetase NAD(P)‑binding subunit and ATP‑binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/27); new base A (3/3); total (31/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
AGTTCAGCCCATCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAATTGCGTTCGCCGGATATTCCACATA > minE/1754093‑1754232 | aGTTCAGCCCATCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAg < 1:164919/71‑1 (MQ=255) ttCAGCCCATCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCg > 1:1908340/1‑71 (MQ=255) cAGCCCATCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGt > 1:157251/1‑71 (MQ=255) cAGCCCATCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGt > 1:153258/1‑71 (MQ=255) aGCCCATCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTg < 1:2838482/71‑1 (MQ=255) cccATCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCa > 1:2966824/1‑71 (MQ=255) cccATCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCa < 1:3356992/71‑1 (MQ=255) cccATCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCa < 1:3360698/71‑1 (MQ=255) ccATCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCat < 1:2270538/71‑1 (MQ=255) ccATCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCat < 1:809576/71‑1 (MQ=255) aTCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCatat < 1:53240/71‑1 (MQ=255) aTCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCatat < 1:2491899/71‑1 (MQ=255) tCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCat < 1:2518848/68‑1 (MQ=255) tCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCat < 1:1745154/68‑1 (MQ=255) ccTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTg > 1:783213/1‑71 (MQ=255) cTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAg > 1:2749733/1‑58 (MQ=255) cTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGc < 1:1926885/59‑1 (MQ=255) cTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGc > 1:1345670/1‑71 (MQ=255) cTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCA‑‑GATAGCACCGAAg > 1:3050930/1‑56 (MQ=255) tGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCa < 1:2922249/64‑1 (MQ=255) cAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCata > 1:1811307/1‑64 (MQ=255) cAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCata > 1:505370/1‑64 (MQ=255) cAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCata > 1:1610653/1‑64 (MQ=255) cAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCata > 1:1366152/1‑64 (MQ=255) cAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCg > 1:2301934/1‑70 (MQ=255) gCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGc < 1:539818/53‑1 (MQ=255) gCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAACGGTGCATATTGCCGAACa < 1:1922287/71‑1 (MQ=255) gTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGaa > 1:2705860/1‑67 (MQ=255) gTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGaa > 1:2080784/1‑67 (MQ=255) tGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTg > 1:1878706/1‑71 (MQ=255) tGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTg < 1:1940289/71‑1 (MQ=255) tGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTg > 1:2034114/1‑71 (MQ=255) aaCACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAg > 1:1176196/1‑40 (MQ=255) aaCACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATcc > 1:1396585/1‑71 (MQ=255) aaCACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATcc > 1:1740375/1‑71 (MQ=255) aaCACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATc > 1:1568170/1‑70 (MQ=255) aaCACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATc > 1:1680304/1‑70 (MQ=255) cacGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTg < 1:45013/62‑1 (MQ=255) cGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCg > 1:963825/1‑38 (MQ=255) cGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACa > 1:1594469/1‑55 (MQ=255) cGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACa > 1:2248264/1‑55 (MQ=255) cGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTg > 1:1948173/1‑71 (MQ=255) cGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTg > 1:2912246/1‑71 (MQ=255) gCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTgg > 1:1622891/1‑71 (MQ=255) aCCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCa > 1:2536123/1‑35 (MQ=255) ccTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGa < 1:651013/69‑1 (MQ=255) ccTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAACGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGaaa < 1:1602296/71‑1 (MQ=255) gATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACa < 1:737623/42‑1 (MQ=255) aTTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAATTGCg < 1:1985515/71‑1 (MQ=255) ttGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGt < 1:1448542/55‑1 (MQ=255) ccAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGaaa > 1:2668958/1‑62 (MQ=255) gCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAATTGCGTTCGCCg < 1:2787627/71‑1 (MQ=255) gCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAATTGCGTTCGCCg < 1:1094552/71‑1 (MQ=255) gCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAATTGCGTTCGCCg < 1:2592398/71‑1 (MQ=255) gCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAATTGCGTTCGCCg < 1:3270021/71‑1 (MQ=255) gCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAATTGCGTTCGCCg < 1:2793237/71‑1 (MQ=255) cGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAATTGCGTTCGCCg < 1:2411067/70‑1 (MQ=255) cGATAGCACCGAAACGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAATTGCGTTCGCCgg < 1:1331937/71‑1 (MQ=255) aTAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTg < 1:2998778/36‑1 (MQ=255) aGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAATTGCGTTCGCCGGatat > 1:1800414/1‑71 (MQ=255) aCCGAAACGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTgg > 1:2647253/1‑43 (MQ=255) aCCGAAACGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAATTGCGTTCGCCGGATATTc > 1:2665051/1‑70 (MQ=255) aCCGAAACGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAATTGCGTTCGCCGGATATTc > 1:748769/1‑70 (MQ=255) ccGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAAtt < 1:1204734/52‑1 (MQ=255) aGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAATTGCGTTCGCCGGATATTCCACATa < 1:1492794/71‑1 (MQ=255) | AGTTCAGCCCATCCTGCAAGCGTATGGCATGAACACGCTCCCTACCTGGATTGCCAGCGATAGCACCGAAGCGGTGCATATTGCCGAACAGATTGGTTATCCGGTGGCGCTGAAATTGCGTTCGCCGGATATTCCACATA > minE/1754093‑1754232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |