| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | = 225281 | NA (NA) | 15 (0.210) | 7/88 | NT | NA | noncoding (1511/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
| ? | AP009048 | = 225293 | NA (NA) | noncoding (1523/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
GGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AP009048/225208‑225281‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaccgCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCTCC < AP009048/225293‑225224 GGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA < 1:3270538/71‑1GGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA < 1:3624413/71‑1GGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA > 1:4490229/1‑71GGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA < 1:5683488/70‑1GGTAGCTTAACATTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA > 1:7878731/1‑70 GTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAAC > 1:2944161/1‑71 GTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAAC > 1:2115097/1‑71 GTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAAC > 1:4599801/1‑71 TAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC > 1:5435751/1‑71 TAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC > 1:1245567/1‑71 TAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAAC > 1:7104839/1‑70 AGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG > 1:1800838/1‑71 AGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG > 1:6134344/1‑71 AGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG > 1:199906/1‑71 AGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG > 1:3407485/1‑71 AGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG > 1:7386383/1‑71 AGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC > 1:1828086/1‑70 GCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:811606/70‑1 GCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG > 1:4162940/1‑70 GCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:7341774/70‑1 GCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG > 1:1420852/1‑70 CTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG > 1:4434046/1‑69 CTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC > 1:6443388/1‑68 CTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC > 1:3331595/1‑68 ACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC > 1:4837922/1‑64 CTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA < 1:4433166/60‑1 CTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA < 1:3821395/60‑1 GGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT < 1:1951149/71‑1 GGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTACGGT > 1:3933054/1‑70 CGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTACGG < 1:2139742/67‑1 GCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACC < 1:7746738/71‑1 TTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCG < 1:7812171/49‑1 CCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA > 1:46039/1‑42 TTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC < 1:1542765/41‑1 TTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA < 1:1932058/38‑1 TTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA < 1:1711174/37‑1 TGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC > 1:3427466/1‑39 TGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACC > 1:6331216/1‑39 TGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAAC > 1:6538402/1‑38 TGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAAC > 1:6953162/1‑38 TGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAAC > 1:2321830/1‑38 GTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA < 1:3641320/36‑1 GTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA < 1:5743822/36‑1 GTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAA < 1:481283/36‑1 TTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTAC < 1:6926171/48‑1 ATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTACGG > 1:7171516/1‑47 ATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCACCTACGG > 1:7459865/1‑47 TGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTAC < 1:5915134/35‑1 TGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTAC < 1:4353733/35‑1 TGAAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTAC < 1:2194016/35‑1 AAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTACGG > 1:3178691/1‑35 AAGTCGTAACAAGGTAACCGCAGGTTCCCCTACGG > 1:7647489/1‑35 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGac > 1:3230320/1‑45 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:5770540/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:6904113/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:1366945/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:5506477/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:1839012/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:3020454/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:7735793/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:4631799/1‑71 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAA > 1:6319815/1‑59 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATC < 1:474293/54‑1 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATG < 1:7315669/50‑1 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTT > 1:4342699/1‑37 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTT > 1:7299736/1‑37 ACCGCAGGTTCCCCTTCGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCC > 1:581205/1‑71 ACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGCCTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCC > 1:384564/1‑71 ACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCC > 1:5272076/1‑71 ACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCC > 1:5100949/1‑71 ACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCC > 1:5642713/1‑70 ACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCACAGTCA > 1:5883738/1‑47 ACCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTT > 1:1669235/1‑36 ACCGCAGGTTCACCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAA > 1:6013305/1‑51 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACGAAGTGGTAAGCGCCCT > 1:4394641/1‑71 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCGCCCT > 1:7397247/1‑71 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAGTGGTAAGCG > 1:3250468/1‑67 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAG < 1:6983389/58‑1 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGAATCACAAAG < 1:7825334/58‑1 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGA < 1:5838881/49‑1 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATGA < 1:5649191/49‑1 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATG < 1:5153078/48‑1 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATG < 1:3982524/48‑1 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTCACCCCAGTCATG < 1:4217671/48‑1 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTACCTTGTTACGACTTC < 1:4141111/36‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |