| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 225282 = | NA (NA) | 14 (0.190) | 5/88 | NT | 100% | noncoding (1512/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
| ? | AP009048 | 225294 = | 0 (0.000) | noncoding (1524/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA | |||||
ACAATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAcggtt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/225351‑225282‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAG > AP009048/225294‑225368 ACAATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAC > 1:4202484/1‑71ACAATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAC > 1:6913084/1‑71ACAATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAC > 1:5459533/1‑71 CAATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACG > 1:2972994/1‑71 AATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGG > 1:2145933/1‑71 AATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAC < 1:2438757/69‑1 ATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT < 1:642870/71‑1 ATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT < 1:7083298/71‑1 ATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT < 1:2070326/71‑1 ATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT < 1:2735088/71‑1 ATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGG < 1:601140/70‑1 TCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT > 1:2881392/1‑70 TCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT > 1:4529787/1‑70 TCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT > 1:5317736/1‑70 TCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT > 1:1748144/1‑70 TGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT < 1:3360059/67‑1 TGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT < 1:391274/67‑1 TGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT < 1:6555714/67‑1 TGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT < 1:5902553/67‑1 TGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT < 1:5574639/67‑1 GTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT < 1:1934226/66‑1 CACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT < 1:6542949/61‑1 CACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT < 1:642097/61‑1 CACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT < 1:5213567/61‑1 TGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT < 1:194459/58‑1 CAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGTAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT > 1:2367041/1‑56 GCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAC < 1:5255875/44‑1 TTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGG < 1:1214970/40‑1 TTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGG < 1:7620566/40‑1 AAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT < 1:1957099/35‑1 TCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGC < 1:3862486/51‑1 CCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAG < 1:6545761/61‑1 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTG < 1:7301555/56‑1 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTG > 1:4932423/1‑56 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACA > 1:7065158/1‑67 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCT > 1:7700553/1‑63 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTTAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATT > 1:3699191/1‑71 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGCA > 1:3746214/1‑56 CCGCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCT > 1:3815819/1‑61 CCGCAGGTTACCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAG > 1:5413074/1‑45 GCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGC > 1:3820747/1‑44 GCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGC > 1:2016545/1‑44 TTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGTAGTGCTCACACAGATTGTCTGAT < 1:7743376/71‑1 TTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGTAGTGCTCACACAGATTGTCTGAT < 1:209523/71‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGA < 1:5511790/71‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGA < 1:5543625/71‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATG < 1:3372407/70‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATG < 1:547430/70‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATG < 1:7520499/70‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAAT < 1:5637089/69‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAAT < 1:6150776/69‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAAT > 1:5921370/1‑69 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAAT < 1:7648295/69‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAAT < 1:5638/69‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAAT < 1:2649008/69‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAAT < 1:3575920/69‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAAT < 1:7040217/69‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAAT < 1:4001004/69‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACAC < 1:6774263/51‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACAC < 1:169617/51‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACT > 1:4519401/1‑36 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACT > 1:5910696/1‑36 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACT > 1:4419015/1‑36 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACT > 1:2229168/1‑36 GGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAG < 1:3059961/71‑1 GGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCA > 1:5717671/1‑40 GGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCA > 1:4106326/1‑40 GTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAG > 1:5826473/1‑70 GTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGA < 1:2908489/52‑1 TTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGA < 1:6932237/51‑1 TTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGA < 1:3923890/51‑1 TTGGATCACCTCCTT‑CCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGA < 1:3881446/50‑1 TGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAG > 1:7603056/1‑71 TGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAG > 1:1783501/1‑71 TGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAG > 1:222064/1‑68 TGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAG > 1:1237938/1‑68 TGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAA > 1:679906/1‑64 TGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTC > 1:2277688/1‑55 TGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTC > 1:1463746/1‑55 ACAATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAcggtt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/225351‑225282‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAG > AP009048/225294‑225368 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |