| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 381056 = | NA (NA) | 10 (0.140) | 7/86 | NT | NA | coding (159/906 nt) | insD | IS2 insertion element transposase InsAB' |
| ? | AP009048 | 381083 = | NA (NA) | coding (186/906 nt) | insD | IS2 insertion element transposase InsAB' | |||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
CTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/381131‑381056‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggagaGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCT > AP009048/381083‑381152 CTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC > 1:3418059/1‑71CTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC < 1:5022742/71‑1CTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC > 1:5650696/1‑71 TGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:5445547/1‑71 GTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:7741180/1‑70 GTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:629700/1‑70 TCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG < 1:2973776/70‑1 TCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:4008209/1‑69 TCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:5687302/1‑69 TCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG < 1:6087479/69‑1 CTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:3073639/1‑68 CTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACG > 1:1592757/1‑68 TGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG > 1:1334305/1‑70 GCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG > 1:3550694/1‑69 GCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG < 1:6666971/67‑1 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCTATAACATGGTGTATACGGAG < 1:7911841/68‑1 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA < 1:6472544/69‑1 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA < 1:4980102/69‑1 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:1851068/68‑1 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:5091518/68‑1 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC < 1:636810/64‑1 CGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC > 1:7653934/1‑64 GAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA < 1:3903297/68‑1 GAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:3883458/67‑1 GAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG < 1:2427982/65‑1 GAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG < 1:981956/65‑1 GAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACAAGGTGTATACGG < 1:410086/65‑1 AGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG > 1:5905452/1‑65 AGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG < 1:6899394/63‑1 CAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA < 1:5198607/64‑1 CAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:2615232/63‑1 AGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA < 1:7309179/61‑1 GCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG < 1:2904104/59‑1 CGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:6914741/60‑1 GCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:1120510/59‑1 GCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC < 1:4338451/55‑1 GCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC < 1:583633/55‑1 GCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC < 1:620837/55‑1 CCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA > 1:4610759/1‑57 CCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC < 1:1904062/54‑1 CCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC < 1:3395678/54‑1 CCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC < 1:5065095/54‑1 CCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:245606/57‑1 CATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA < 1:4132791/55‑1 TACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA < 1:2140255/53‑1 TACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA < 1:5338981/53‑1 ACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATAC > 1:468859/1‑49 CCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA > 1:235577/1‑53 CCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA > 1:1168335/1‑53 CCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA < 1:2838426/51‑1 CCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG < 1:252808/49‑1 GACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA > 1:1764946/1‑50 GACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGA > 1:6837966/1‑50 GACGATAACCATACCTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA > 1:1412414/1‑48 ATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:7879476/45‑1 ACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA < 1:4453901/41‑1 ACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG > 1:3116526/1‑40 ACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG > 1:6689535/1‑40 CATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG > 1:2346602/1‑40 CATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA > 1:6232212/1‑39 CATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA > 1:2191068/1‑39 CATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA > 1:4161107/1‑39 TACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAG < 1:3651390/38‑1 TACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGG < 1:1693230/36‑1 ACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA > 1:3801172/1‑36 ACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGA > 1:271073/1‑36 CTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAGATGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCG < 1:6449171/70‑1 TCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTT < 1:23752/67‑1 TCCGATAACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGA > 1:4761136/1‑71 AACATGGTGTATACGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGG > 1:7400038/1‑69 CGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACT > 1:6981562/1‑63 CGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCG > 1:2110602/1‑48 CGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATG > 1:517457/1‑36 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |