| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 914231 = | 82 (1.010) | 4 (0.060) | 3/84 | NT | 7.3% | coding (6/1653 nt) | hcp | hybrid‑cluster [4Fe‑2S‑2O] protein in anaerobic terminal reductases |
| ? | AP009048 | 914275 = | 31 (0.440) | intergenic (‑39/+105) | hcp/ybjE | hybrid‑cluster [4Fe‑2S‑2O] protein in anaerobic terminal reductases/predicted transporter | |||||
CTTTTATCCCCGCGTTAAGCGTCTTAACCTTAAACATGTATATTAAATATAACTTTAAAAGGTGTGATCATGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/914305‑914231‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑catgtttAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAG > AP009048/914275‑914341 CTTTTATCCCCGCGTTAAGCGTCTTAACCTTAAACATGTATATTAAATATAACTTTAAAAGGTGTGATCAT < 1:173824/71‑1CTTTTATCCCCGCGTTAAGCGTCTTAACCTTAAACATGTATATTAAATATAACTTTAAAAGGTGTGATCAT < 1:2232190/71‑1 TAAGCGTCTTAACCTTAAACATGTATATTAAATATAACTTTAAAAGGTGTGATCAT < 1:2540343/56‑1 TAAGCGTCTTAACCTTAAACATGTATATTAAATATAACTTTAAAAGGTGTGATCAT < 1:5040486/56‑1 TAAACATGTATATTAAATATAACTTTAAAAGGTGTGATCATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCAGGGA > 1:3740380/1‑70 AAACATGTATATTAAATATAACTTTAAAAGGTGTGATCATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACG < 1:1023760/63‑1 AAACATGTATATTAAATATAACTTTAAAAGGTGTGATCATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACG < 1:6313717/63‑1 AACTTTAAAAGGTGTGATCATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTT > 1:4801739/1‑62 CATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATT < 1:1007088/71‑1 CATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATT > 1:5721708/1‑71 CATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATT < 1:6836922/71‑1 CATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCA > 1:4815926/1‑48 CATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCA > 1:323586/1‑48 ATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAG > 1:120951/1‑59 ATGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAG > 1:7878363/1‑59 TGTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTA < 1:4288073/71‑1 GTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAG > 1:6965201/1‑71 GTTTAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCA > 1:7202122/1‑49 TAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGA > 1:6128786/1‑57 CTTTTATCCCCGCGTTAAGCGTCTTAACCTTAAACATGTATATTAAATATAACTTTAAAAGGTGTGATCATGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/914305‑914231‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑catgtttAAGGTTAAGACGCTTAACGCGGGGATAAAAGGGATTTTTCATGCAACTTTAAGGGAGATTGATTTAG > AP009048/914275‑914341 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |