| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | = 344428 | 75 (0.920) | 7 (0.090) | 4/96 | NT | 8.0% | intergenic (+213/‑200) | yahL/yahM | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | AP009048 | = 344452 | 87 (1.090) | intergenic (+237/‑176) | yahL/yahM | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CGCTTAAAAAAGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTTGTGTGGGGTCTTTTCT > AP009048/344358‑344497 | cTTAAAAAAGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTT < 1:126463‑M1/69‑1 (MQ=255) cTTAAAAAAGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTAATGCAGATGTTTtgt < 1:6185226/71‑1 (MQ=255) tAAAAAAGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTtgtg > 1:7139015/1‑70 (MQ=255) aaaaaaGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTtgtg < 1:360566/69‑1 (MQ=255) aaaaaaGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTtgtg < 1:5170087/69‑1 (MQ=255) aaaaaaGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTtgtg < 1:6054227/69‑1 (MQ=255) aaaaaGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTtgtg < 1:3199899/68‑1 (MQ=255) aaaaGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAAtg > 1:1450100/1‑71 (MQ=255) aaaaGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAAtg > 1:5884952/1‑71 (MQ=255) aaGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTatgaatgt > 1:700616‑M1/1‑62 (MQ=255) aaGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATCATCTCATGCAGATGTTTTat > 1:3476420‑M1/1‑62 (MQ=255) aGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATgtgt < 1:1074582/71‑1 (MQ=255) aGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATgtgt > 1:4300902/1‑71 (MQ=255) aGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATgtgt < 1:6552823/71‑1 (MQ=255) gCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTgtt > 1:390489/1‑71 (MQ=255) ccAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTgttggt < 1:1854290/71‑1 (MQ=255) ccAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTgttggt < 1:2419861/71‑1 (MQ=255) cAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTgttggtt > 1:6333995/1‑71 (MQ=255) cAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTgttggtt < 1:5071271/71‑1 (MQ=255) cAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTgttggtt > 1:6342957/1‑71 (MQ=255) cAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTgttggtt < 1:4023540/71‑1 (MQ=255) agtagtGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTgttggtt > 1:2480765/1‑70 (MQ=255) gtGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACa < 1:6758432/70‑1 (MQ=255) gTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGaa > 1:7541233/1‑53 (MQ=255) tttCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCat < 1:1891208/71‑1 (MQ=255) tttCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCat < 1:6360538/71‑1 (MQ=255) cGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCatat < 1:5848751/70‑1 (MQ=255) cGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCa < 1:5325295/67‑1 (MQ=255) cAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATTTGTTGGTTGACATTCATa < 1:6919183‑M2/67‑2 (MQ=255) cAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACAt > 1:2684902/1‑62 (MQ=255) aGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTatgaatgtcaaccaacacattcacaa < 1:2018366‑M1/67‑27 (MQ=255) aGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTatgaatgtcaaccaacacattcacaa < 1:2899660‑M1/67‑27 (MQ=255) aGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTgttgg > 1:5395368/1‑54 (MQ=255) aGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGaa > 1:6472351/1‑70 (MQ=255) gCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGaaa > 1:2765418/1‑70 (MQ=255) ccATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTc < 1:1521402/61‑1 (MQ=255) cATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGaaaaa > 1:3832939/1‑70 (MQ=255) gCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGaaaaaaa > 1:2650962/1‑69 (MQ=255) gCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAAt > 1:4924622/1‑70 (MQ=255) cGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATc < 1:6167558/70‑1 (MQ=255) cGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATc < 1:7048372/70‑1 (MQ=255) tgtgtaTAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATa > 1:1970170‑M2/2‑57 (MQ=255) gtgtATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTtgtg < 1:2403862/35‑1 (MQ=255) gtgtATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTtgtg < 1:7655195/35‑1 (MQ=255) gtgtATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATgtgt < 1:4911976/42‑1 (MQ=255) gtgtATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATgtgt < 1:903651/42‑1 (MQ=255) gtgtATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCAt < 1:6605214/70‑1 (MQ=255) gtgtATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATa < 1:7162306/71‑1 (MQ=255) tgtATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATaa < 1:3194025/71‑1 (MQ=255) gtATAAAAAATGTTCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAAt > 1:6290672/1‑71 (MQ=255) gtATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATgtgt > 1:7793842/1‑40 (MQ=255) tataAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGaaaa < 1:1311213/60‑1 (MQ=255) taAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACAtt < 1:4883906/48‑1 (MQ=255) aaaaaaTGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTgttggt < 1:6584318/40‑1 (MQ=255) aaaaaTGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCa > 1:6183122/1‑48 (MQ=255) aaaaaTGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATa > 1:144687/1‑64 (MQ=255) ataaTGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATaa < 1:3488639/62‑1 (MQ=255) aaaaTGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTgttggtt > 1:4619896/1‑39 (MQ=255) aaaaTGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAAt < 1:6043915/59‑1 (MQ=255) aaaTGATCTCATGCAGATGTTTTatgaatgtcaaccaacacatt > 1:5123349‑M1/1‑23 (MQ=255) aaaTGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCcatca > 1:3775332/1‑71 (MQ=255) aaaTGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCcatca > 1:2849150/1‑71 (MQ=255) aaTGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTc > 1:6392829/1‑44 (MQ=255) gATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGtt > 1:445976/1‑71 (MQ=255) ctcATGCAGATGTTTTatgaatgtcaaccaacacattcac > 1:1872238‑M1/1‑16 (MQ=255) ctcATGCAGATGTTTTatgaatgtcaaccaacacattcac > 1:4548155‑M1/1‑16 (MQ=255) tcATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGttt < 1:1290527/68‑1 (MQ=255) tcATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTtg > 1:883490/1‑69 (MQ=255) aTGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTtgtg < 1:582909/69‑1 (MQ=255) aTGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTtgtg < 1:6702256/69‑1 (MQ=255) cAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTTGTGTggg < 1:29598/70‑1 (MQ=255) aGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTtgtg > 1:4567700/1‑65 (MQ=255) tGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTTGTGTGGGGTCtt < 1:4781187/71‑1 (MQ=255) gTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTc > 1:2253020/1‑48 (MQ=255) gTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTTGTGTgg > 1:7173899/1‑64 (MQ=255) gTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTTGTGTgg > 1:5527678/1‑64 (MQ=255) ttttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATGATAATTCCATCATGttt < 1:1210840/57‑1 (MQ=255) ttttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTtgtgtg < 1:2284719/62‑1 (MQ=255) ttttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTtgtgtg < 1:2690300/62‑1 (MQ=255) ttttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTTGTGTGGGGTCtttt < 1:4741496/71‑1 (MQ=255) ttttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTTGTGTGGGGTCtttt < 1:6725437/71‑1 (MQ=255) tttGTGAATGTGTTTGTTGACATTAATATGAAAAAAATCATaa > 1:162625/1‑43 (MQ=38) tttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATaa > 1:3518073/1‑43 (MQ=255) tttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTTGTGTGGGGTCTTTTc > 1:7047751/1‑71 (MQ=255) tttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTTGTGTGGGGTCTTTTc > 1:201015/1‑71 (MQ=255) ttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATaaaacatctgcatgagatcattttttatacaccgcatggct < 1:2018366‑M2/67‑42 (MQ=255) ttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATaaaacatctgcatgagatcattttttatacaccgcatggct < 1:2899660‑M2/67‑42 (MQ=255) ttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATc > 1:1123580/1‑38 (MQ=255) ttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATc > 1:2725545/1‑38 (MQ=255) ttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATc > 1:1996714/1‑38 (MQ=255) ttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGtt < 1:6108141/54‑1 (MQ=255) ttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGtt < 1:4541436/54‑1 (MQ=255) ttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGtt < 1:1450900/54‑1 (MQ=255) ttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTTGTGTGGGGTCTTTTc < 1:691231/70‑1 (MQ=255) ttGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTTGTGTGGGGTCTTTTc < 1:2270241/70‑1 (MQ=255) ttGTGAATGTGTTGGATGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTTGTGTGGGGTCTTTTc < 1:3094603/70‑1 (MQ=255) tatgaatgtcaaccaacacattcacaaaacatctgcatgagatcattttttatacaccgcatggctg < 1:4292742‑M1/67‑67 (MQ=255) tatgaatgtcaaccaacacattcacaaaacatctgcatgagatcattttttatacaca > 1:1970170‑M1/1‑1 (MQ=255) tatgaatgtcaaccaacacattcacaaaacatctacatgagatcattttttatacaccgcatggctgcga > 1:1852893‑M1/1‑1 (MQ=255) tatgaatgtcaaccaacaaattcacaaaacatctgcatgagatcattttttatacaccgcatggctg < 1:6919183‑M1/67‑67 (MQ=255) | CGCTTAAAAAAGCACCAGTAGTGGTTTCGCAGCCATGCGGTGTATAAAAAATGATCTCATGCAGATGTTTTGTGAATGTGTTGGTTGACATTCATATGAAAAAAATCATAATTCCATCATGTTTGTGTGGGGTCTTTTCT > AP009048/344358‑344497 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |