| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | = 3481934 | 64 (0.790) | 6 (0.080) | 3/88 | NT | 9.1% | coding (101/1152 nt) | argE | acetylornithine deacetylase |
| ? | AP009048 | = 3481943 | 63 (0.860) | coding (110/1152 nt) | argE | acetylornithine deacetylase | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TTACCGCGCTCTGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGAAGTGCAGCCTGTTCCAGG > AP009048/3481866‑3482003 | ttACCGCGCTCTGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGAtt > 1:5268821/1‑71 (MQ=255) tACCGCGCTCTGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGAtt < 1:1139132/70‑1 (MQ=255) tACCGCGCTCTGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGAtt > 1:6305536/1‑70 (MQ=255) ccGCGCTCTGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTa < 1:3677350/70‑1 (MQ=255) ccGCGCTCTGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTa < 1:881428/70‑1 (MQ=255) ccGCGCTCTGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTa < 1:2366035/70‑1 (MQ=255) cgcgCTCTGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAAt < 1:4468897/71‑1 (MQ=255) cgcgCTCTGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAAt < 1:3026732/71‑1 (MQ=255) gcgcTCTGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAAt > 1:6149744/1‑70 (MQ=255) gcgcTCTGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAAt > 1:1969432/1‑70 (MQ=255) ctGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACtct < 1:5891148‑M2/71‑4 (MQ=255) tGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGAttt > 1:5939474/1‑61 (MQ=255) tGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTaa > 1:7235397/1‑63 (MQ=255) aTTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAAt > 1:891453/1‑62 (MQ=255) ttGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACt < 1:1445199‑M2/65‑2 (MQ=255) tGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTctgctg > 1:6128781/1‑70 (MQ=255) tGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTgg > 1:142005/1‑71 (MQ=255) gCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGc > 1:6301183/1‑71 (MQ=255) acacCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGa < 1:3607612/71‑1 (MQ=255) cacCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGAtt > 1:5947732/1‑51 (MQ=255) cacCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGAtt > 1:4949850/1‑51 (MQ=255) ttCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGGTGGCGGACTGGt > 1:2597959/1‑71 (MQ=255) cAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGt < 1:1141900/69‑1 (MQ=255) aaTAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGttt > 1:2835869/1‑70 (MQ=255) aTAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGttt > 1:4068422/1‑69 (MQ=255) aTAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTa > 1:682433/1‑70 (MQ=255) tAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTgg > 1:1662723/1‑65 (MQ=255) aaGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGc > 1:31946/1‑57 (MQ=255) aGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTctgctg > 1:6709001/1‑54 (MQ=255) aGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTctgctg > 1:6832367/1‑54 (MQ=255) aGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTctgctg > 1:3906976/1‑54 (MQ=255) aGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTa > 1:5265287/1‑67 (MQ=255) gcCACGGAAGAGTCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGAtt < 1:3589333/70‑1 (MQ=255) gcCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGAtt < 1:7884352/70‑1 (MQ=255) aCGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGAgtgattaaatctgcat > 1:6221203‑M1/1‑32 (MQ=255) aCGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGAgtgattaaatctgcat > 1:1086981‑M1/1‑32 (MQ=255) aCGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGAgtgattaaatctgcat > 1:7108746‑M1/1‑32 (MQ=255) aCGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGAgtgattaaatctgcat > 1:5798814‑M1/1‑32 (MQ=255) aCGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACtctgc < 1:4643748‑M2/46‑6 (MQ=255) aCGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGtt > 1:4334429/1‑59 (MQ=255) aCGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGtt > 1:7639175/1‑59 (MQ=255) cGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGc > 1:7732275/1‑71 (MQ=255) cGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGc > 1:6962542/1‑71 (MQ=255) cGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGc > 1:5888636/1‑71 (MQ=255) cGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGc > 1:4940098/1‑71 (MQ=255) ggAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCt > 1:7172435/1‑71 (MQ=255) ggAAGAGGCACTAGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCt > 1:623041/1‑71 (MQ=255) aaGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTggg > 1:1413233/1‑67 (MQ=255) gagGCACTCGATCAAAGCAATGCAGAgtgattaaatctg < 1:4067422‑M1/39‑14 (MQ=255) agGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAGTCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAAt < 1:7620578/71‑1 (MQ=255) agGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCg < 1:3026505/44‑1 (MQ=255) agGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGAtt < 1:6388564/60‑1 (MQ=255) agGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGAtt < 1:4800730/60‑1 (MQ=255) agGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGAtt < 1:3393607/60‑1 (MQ=255) ggCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAAtg < 1:4822140/71‑1 (MQ=255) cACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAAtgtg < 1:5810573/71‑1 (MQ=255) aCTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAAtgtg > 1:1040119/1‑70 (MQ=255) aCTCGATCAAAGCAATGCAGATATAATCACtctgc < 1:3207525‑M2/35‑6 (MQ=255) tCGATCAAAGCAATGCAGAgtgattaaatctgcattgctttgatcga < 1:858751‑M1/47‑29 (MQ=255) tCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACtctgcattgctttgatcga < 1:858751‑M2/47‑20 (MQ=255) tCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTctgctg < 1:5284340/35‑1 (MQ=255) tCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTctgctg < 1:243716/35‑1 (MQ=255) tCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTgg > 1:486431/1‑69 (MQ=255) tCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTgg > 1:1304446/1‑69 (MQ=255) tCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTgg > 1:2527869/1‑69 (MQ=255) cGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTaa > 1:1200722/1‑48 (MQ=255) cGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCaa > 1:7811620/1‑63 (MQ=255) cGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGCTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGAAg > 1:4256926/1‑71 (MQ=255) gATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGAAGt > 1:6885519/1‑71 (MQ=255) gATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGAAGt > 1:3122281/1‑71 (MQ=255) aTCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTa < 1:3776856/45‑1 (MQ=255) tCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCa < 1:5519638/59‑1 (MQ=255) cAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGaa > 1:6181229/1‑66 (MQ=255) aaaGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACt > 1:6484072/1‑36 (MQ=255) aaaGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGc < 1:5842038/53‑1 (MQ=255) aaaGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGaa > 1:6484067/1‑65 (MQ=255) aGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGAAGTGCAGc > 1:6831125/1‑70 (MQ=255) cAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGAAGTGCAGCCTg > 1:82088/1‑71 (MQ=255) aaTGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGAAGTGCAGCCTGt < 1:4384043/71‑1 (MQ=255) aTGCAGATTTAATCACtctgcattgctttgatcgagtgcctcttccgt > 1:1086981‑M2/1‑16 (MQ=255) aTGCAGATTTAATCACtctgcattgctttgatcgagtgcctcttccgt > 1:6221203‑M2/1‑16 (MQ=255) aTGCAGATTTAATCACtctgcattgctttgatcgagtgcctcttccgt > 1:5798814‑M2/1‑16 (MQ=255) aTGCAGATTTAATCACtctgcattgctttgatcgagtgcctcttccgt > 1:7108746‑M2/1‑16 (MQ=255) aTGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGAAGTGCAGCCTGtt > 1:5760838/1‑71 (MQ=255) tGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGAAGTGCAGCCTGTTc < 1:7122967/71‑1 (MQ=255) gCAGAgtgattatatctgcattgctttgatcgagt < 1:3207525‑M1/35‑31 (MQ=255) gCAGAgtgattaaatctgcattgctttgatcgagtgcctcttccgt < 1:4643748‑M1/46‑42 (MQ=255) gCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGTACTGGTTTAAAGATTTgg < 1:683758/43‑1 (MQ=255) cAGATTTAATCACtctgcattgctttgatcgagtgcctc < 1:4067422‑M2/39‑27 (MQ=255) agagtgattaaatctgcattgctttgatcgagtgcctcttccgtggcgcttattgaaggtgtggcaatcag < 1:5891148‑M1/71‑69 (MQ=255) aGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGAAGTGCAGCCTGTTCCa < 1:2689509/70‑1 (MQ=255) aGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTCGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGAAGTGCAGCCTGTTCCa < 1:4892738/70‑1 (MQ=255) gATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGAAGTGCAGCCTGTTCCAgg < 1:1181891/71‑1 (MQ=255) gATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGAAGTGCAGCCTGTTCCAgg < 1:3089314/71‑1 (MQ=255) agtgattaaatctgcattgctttgatcgagtgcctcttccgtggcgcttattgaaggtgtggcaa < 1:1445199‑M1/65‑65 (MQ=255) aTTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGAttt < 1:7300128/37‑1 (MQ=255) aTTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGAttt < 1:7928300/37‑1 (MQ=255) aTTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGAttt < 1:2113804/37‑1 (MQ=255) aTTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGAttt < 1:6527941/37‑1 (MQ=255) aTTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGAttt < 1:1495540/37‑1 (MQ=255) | TTACCGCGCTCTGATTGCCACACCTTCAATAAGCGCCACGGAAGAGGCACTCGATCAAAGCAATGCAGATTTAATCACTCTGCTGGCGGACTGGTTTAAAGATTTGGGCTTCAATGTGGAAGTGCAGCCTGTTCCAGG > AP009048/3481866‑3482003 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |