| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 1614648 = | 84 (1.030) | 6 (0.080) | 3/94 | NT | 6.6% | coding (318/927 nt) | yneH | predicted glutaminase |
| ? | AP009048 | 1614673 = | 90 (1.150) | coding (293/927 nt) | yneH | predicted glutaminase | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
AGCGCACCGGCATTAATGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCTTCGGAGTAATGACGCATGGCGAC > AP009048/1614604‑1614743 | aGCGCACCGGCATTAATGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGaa < 1:2905740/71‑1 (MQ=255)aGCGCACCGGCATTAATGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGaa > 1:4968125/1‑71 (MQ=255)aGCGCACCGGCATTAATGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGaa > 1:4958771/1‑71 (MQ=255) gcACCGGCATTTATGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACgg < 1:2009435/71‑1 (MQ=255) gcACCGGCATTAATGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACgg < 1:3691968/71‑1 (MQ=255) gcACCGGCATTAATGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACgg < 1:3306255/71‑1 (MQ=255) atctggcaacgcgtcggcaaagatccgtctggatcaccgttCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGaa < 1:3886219‑M1/27‑1 (MQ=255) cACCGGCATTAATGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGt < 1:1854296/71‑1 (MQ=255) aCCGGCATTAATGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGt > 1:6612938/1‑70 (MQ=255) aCCGGCATTAATGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTg < 1:1425483/71‑1 (MQ=255) ccGACATTAATGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGa < 1:1487152/71‑1 (MQ=255) aTTAATGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTg < 1:4486609/65‑1 (MQ=255) tAATGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGAc > 1:6227596/1‑71 (MQ=255) aTGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACgg < 1:7012981/71‑1 (MQ=255) gAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGaa < 1:237236/54‑1 (MQ=255) gAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGAt > 1:5529431/1‑71 (MQ=255) gAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGAt > 1:1152532/1‑71 (MQ=255) aaCGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGAt < 1:2208035/70‑1 (MQ=255) aaCGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATc > 1:367458/1‑71 (MQ=255) aaCGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATc > 1:623955/1‑71 (MQ=255) aCGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACTGATCt < 1:3710604/71‑1 (MQ=255) aCGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCt < 1:1959061/71‑1 (MQ=255) aCGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCt < 1:4050780/71‑1 (MQ=255) cGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATc > 1:3236951/1‑59 (MQ=255) cGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCtt > 1:5235000/1‑71 (MQ=255) ggATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACg > 1:4226105/1‑64 (MQ=255) ggATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCttt < 1:4322488/71‑1 (MQ=255) ggATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCttt < 1:6007221/71‑1 (MQ=255) gATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGATTTGAACGGTGATACAGACGGATCTTTg < 1:1251710/71‑1 (MQ=255) ttACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGAt < 1:4055603/64‑1 (MQ=255) tACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCt < 1:147019/65‑1 (MQ=255) aCGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCt > 1:7489468/1‑64 (MQ=255) aCGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCt > 1:651265/1‑64 (MQ=255) cgcgGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGa < 1:2262192/70‑1 (MQ=255) cgcgGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGa < 1:3116349/70‑1 (MQ=255) ggTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGcc > 1:3416535/1‑65 (MQ=255) ggTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGcc > 1:1432616/1‑65 (MQ=255) tataCCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCtt < 1:246409/59‑1 (MQ=255) tataCCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCtt < 1:1335843/59‑1 (MQ=255) ataCCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGAcg < 1:7147218/66‑1 (MQ=255) taCCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCTGAcg < 1:1715086/65‑1 (MQ=255) taCCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGtt > 1:3733501/1‑69 (MQ=255) taCCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTg < 1:4132604/70‑1 (MQ=255) taCCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGc > 1:1177064/1‑71 (MQ=255) aCCCTGGTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGAcg < 1:5370381/64‑1 (MQ=255) cccTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACg > 1:3561403/1‑37 (MQ=255) cccTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGa > 1:7467395/1‑61 (MQ=255) cccTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCa < 1:7531108/71‑1 (MQ=255) ccTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTg < 1:350694/67‑1 (MQ=255) cTGCTCCATTTCCAGTTTCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGa < 1:4755912/71‑1 (MQ=255) cTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGa < 1:1262624/71‑1 (MQ=255) tGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGTAATTGAACGGTGAt < 1:1897029/39‑1 (MQ=255) tGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGAt < 1:1707353/39‑1 (MQ=255) tGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCa < 1:7794124/42‑1 (MQ=255) tGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCttt > 1:2684079/1‑53 (MQ=255) tGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGc > 1:4565685/1‑55 (MQ=255) tGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCAAGACGGATCTTTGc > 1:1206634/1‑55 (MQ=255) tGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGAAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCttt > 1:3117009/1‑53 (MQ=255) tGCTACATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCt > 1:3701990/1‑51 (MQ=255) gCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCttt < 1:2543380/52‑1 (MQ=255) cTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGa > 1:3116005/1‑42 (MQ=255) cTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGa > 1:3471118/1‑42 (MQ=255) cTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCC‑ACGCGTTGCCAGAtt < 1:5218153/69‑1 (MQ=255) caattccttagtgcaactggaaatgAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCGGATTTCct > 1:3635261‑M2/26‑71 (MQ=255) caattccttagtgcaactggaaatgAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCct > 1:2265011‑M2/26‑71 (MQ=255) CATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTg < 1:4712457‑M1/60‑1 (MQ=255) CATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTcc > 1:223580‑M1/1‑70 (MQ=255) ATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGAcgcg > 1:1391618‑M1/1‑56 (MQ=255) tttCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCa < 1:7141172/35‑1 (MQ=255) tttCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCa < 1:1915821/35‑1 (MQ=255) tttCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGa < 1:5089696/37‑1 (MQ=255) tttCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCttt > 1:7286003/1‑46 (MQ=255) tttCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGt > 1:2068196/1‑56 (MQ=255) tttCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGt > 1:1739917/1‑56 (MQ=255) tttCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGt > 1:2424322/1‑56 (MQ=255) ttccttagtgcaactggaaatgAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCtt < 1:5088198‑M2/49‑1 (MQ=255) ttccttagtgcaactggaaatgAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCtt < 1:5079217‑M2/49‑1 (MQ=255) ttccttagtgcaactggaaatgAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCtt < 1:2866975‑M2/49‑1 (MQ=255) tCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCtt < 1:3577059/70‑1 (MQ=255) tCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCtt < 1:2106714/70‑1 (MQ=255) tCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCTTc > 1:683377/1‑71 (MQ=255) tCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCTTc > 1:5071701/1‑71 (MQ=255) tCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCTTc > 1:1688747/1‑71 (MQ=255) aGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCTTCg > 1:2027660/1‑69 (MQ=255) gTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCTTCGGAg > 1:592685/1‑71 (MQ=255) atGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCTTCGGAg > 1:2567576/2‑70 (MQ=255) tGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGAcg < 1:6166186/45‑1 (MQ=255) tGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCTTCGGAGt > 1:6911858/1‑70 (MQ=255) tGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCTTCGGAGt > 1:4676024/1‑70 (MQ=255) tAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTcc < 1:4567597/55‑1 (MQ=255) tAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCctct > 1:7063347/1‑58 (MQ=255) tAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCtt > 1:6464103/1‑59 (MQ=255) tAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCtt > 1:5590198/1‑59 (MQ=255) aaGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAg < 1:6475959/48‑1 (MQ=255) aTTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCTTCGGAGTAATGACg < 1:4101477/66‑1 (MQ=255) ttGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCTTCGGAGTa < 1:1319564/59‑1 (MQ=255) ttGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCTTCGGAGTAATGACGCATGGc > 1:6766347/1‑71 (MQ=255) gAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTc > 1:5616462‑M2/2‑45 (MQ=255) gAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTc > 1:7913269‑M2/2‑45 (MQ=255) aaCGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCTTCGGAGTAATGACGCATGGCGAc < 1:6185117/71‑1 (MQ=255) | AGCGCACCGGCATTAATGAACGGATTACGCGGTATACCCTGCTCCATTTCCAGTTGCACTAAGGAATTGAACGGTGATCCAGACGGATCTTTGCCGACGCGTTGCCAGATTTCCTCTTCGGAGTAATGACGCATGGCGAC > AP009048/1614604‑1614743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |