| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 3734101 = | 137 (1.680) | 7 (0.100) | 3/84 | NT | 7.1% | coding (1122/1413 nt) | bglB | cryptic phospho‑beta‑glucosidase B |
| ? | AP009048 | 3734124 = | 65 (0.930) | coding (1145/1413 nt) | bglB | cryptic phospho‑beta‑glucosidase B | |||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
GTCGAGAACGGATTAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGATGGTGTGGATATTATGGGG > AP009048/3734057‑3734191 | tCGAGAACGGATTAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGcc > 1:3845799/1‑71 (MQ=255) tCGAGAACGGATTAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGcc < 1:3976741/71‑1 (MQ=255) cGAGAACGGATTAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGcc > 1:507204/1‑70 (MQ=255) gagaACGGATTAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTa > 1:2724935/1‑71 (MQ=255) aaCGGATTAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTAtt > 1:5254272/1‑70 (MQ=255) aCGGATTAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTAttt < 1:7183227/70‑1 (MQ=255) cGGATTAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAAt > 1:2651813/1‑60 (MQ=255) cGGATTAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTaa < 1:5458720/71‑1 (MQ=255) cGGATTAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTa > 1:7623566/1‑70 (MQ=255) gATTAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAAc < 1:5278767/71‑1 (MQ=255) ttAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGa < 1:5133138/71‑1 (MQ=255) tAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGAt > 1:7413450/1‑71 (MQ=255) tAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGAt > 1:7202961/1‑71 (MQ=255) tAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGAt > 1:5853933/1‑71 (MQ=255) aGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGAt < 1:5993624/70‑1 (MQ=255) ggCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATc < 1:2676588/70‑1 (MQ=255) gtaccaggtgatcgtttaaataggcaaTTCGATACAGGACGATTATCGAAtt < 1:2492911‑M1/25‑1 (MQ=255) gtaccaggtgatcgtttaaataggcaaTTCGATACAGGACGATTATCGAAtt < 1:3640844‑M1/25‑1 (MQ=255) gcAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCt > 1:804167/1‑71 (MQ=255) aaaaGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTgg > 1:203911/1‑71 (MQ=255) aaaaGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTgg > 1:6865078/1‑71 (MQ=255) aaaGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTAt < 1:4421482/54‑1 (MQ=255) aaaGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTgg > 1:2546338/1‑70 (MQ=255) aaGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGc > 1:7583401/1‑49 (MQ=255) aaGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGc > 1:4400924/1‑49 (MQ=255) aaGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTa > 1:2144060/1‑71 (MQ=255) aaGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTCCCTATTTAAACGATCACCTGGTa > 1:5827743/1‑71 (MQ=255) aGACAGCGTTGATGCGGATGCTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTAc < 1:2690945/71‑1 (MQ=255) gACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGc > 1:4322542/1‑47 (MQ=255) gACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTa > 1:1289589/1‑69 (MQ=255) gACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTa > 1:903206/1‑69 (MQ=255) gatcgtttaaataggcaaTTCGATACAGGACGATTATCGAAt < 1:2394212‑M1/24‑1 (MQ=255) gatcgtttaaataggcaaTTCGATACAGGACGATTATCGAAt < 1:1588503‑M1/24‑1 (MQ=255) cAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTaaa > 1:4274987/1‑54 (MQ=255) aGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAAt < 1:4053040/41‑1 (MQ=255) aGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAAt < 1:1036245/41‑1 (MQ=255) aGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAAt < 1:212389/41‑1 (MQ=255) gCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTa < 1:4286417/71‑1 (MQ=255) cGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGcat < 1:3198286/44‑3 (MQ=255) gTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTAc < 1:3502957/64‑1 (MQ=255) tGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAAt > 1:6436957/1‑70 (MQ=255) gAAGCGGATGGTTCGATACAGTACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATg < 1:4964971/70‑1 (MQ=255) gAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTgg < 1:1474665/58‑1 (MQ=255) gAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTgg < 1:5865089/58‑1 (MQ=255) gAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAAt > 1:6219446/1‑69 (MQ=255) gAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATg < 1:4948300/70‑1 (MQ=255) gAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATg < 1:6918724/70‑1 (MQ=255) aaGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATg > 1:3666500/1‑69 (MQ=255) aaGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGa < 1:5741024/70‑1 (MQ=255) gCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGc < 1:4567835/71‑1 (MQ=255) gCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGc < 1:4652800/71‑1 (MQ=255) cGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGc > 1:3521449/1‑70 (MQ=255) gATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGa < 1:7402556/70‑1 (MQ=255) aattcgataatcgtcctgtatcgaaTTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTAc < 1:3640844‑M2/27‑1 (MQ=255) aattcgataatcgtcctgtatcgaaTTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTAc < 1:2492911‑M2/27‑1 (MQ=255) gTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGcc < 1:1742965/71‑1 (MQ=255) gTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGcc < 1:1115468/71‑1 (MQ=255) attcgataatcgtcctgtatcgaaTTGCCTATTTAAACGATc < 1:2323124‑M2/18‑1 (MQ=255) attcgataatcgtcctgtatcgaaTTGCCTATTTAAACGATc < 1:1588503‑M2/18‑1 (MQ=255) TTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCAc > 1:3947966‑M1/1‑43 (MQ=255) TTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCAc > 1:2321963‑M1/1‑43 (MQ=255) TTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGcc < 1:6741960‑M1/70‑1 (MQ=255) tcgataatcgtcctgtatcgaaTTGACTATTTAAACGATCAc > 1:3551505‑M2/23‑42 (MQ=255) TCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCAc < 1:2754061‑M1/42‑1 (MQ=255) TCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCAc < 1:1223372‑M1/42‑1 (MQ=255) CGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAATGATCACCt < 1:4786374‑M1/43‑1 (MQ=255) CGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCt < 1:3436216‑M1/43‑1 (MQ=255) CGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTgg < 1:459525‑M1/45‑1 (MQ=255) CGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGAt < 1:2155482‑M1/71‑1 (MQ=255) CGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGAt < 1:2698948‑M1/71‑1 (MQ=255) CGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGAt < 1:1417548‑M1/71‑1 (MQ=255) CGATACAGGACCATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCAc < 1:5577706‑M1/41‑1 (MQ=255) ATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCAcc > 1:7423237‑M1/1‑40 (MQ=255) ATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCAcc > 1:626208‑M1/1‑40 (MQ=255) TACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGa > 1:1863202‑M1/1‑67 (MQ=255) TACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGa > 1:312028‑M1/1‑67 (MQ=255) cAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATg < 1:4757991/52‑1 (MQ=255) aGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTg < 1:6489805/38‑1 (MQ=255) ggACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGATGgt < 1:4132687/67‑1 (MQ=255) ggACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGATGGtgtg > 1:2287011/1‑70 (MQ=255) ggAAGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGATACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGATGGtgtg > 1:1639816/1‑70 (MQ=255) gATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCg < 1:5354286/58‑1 (MQ=255) gATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGATGGTGTGGatat < 1:1735758/71‑1 (MQ=255) gATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGATGGTGTGGatat > 1:5562891/1‑71 (MQ=255) aTTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGt < 1:4284531/40‑1 (MQ=255) aTTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGa < 1:2001688/46‑1 (MQ=255) ttATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGATGGTGTGGAtatta > 1:3699206/1‑71 (MQ=255) tatcgaaTTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAg > 1:7015553‑M2/8‑46 (MQ=255) tatcgaaTTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGATGGTGTGGAtattat > 1:4077588‑M2/8‑71 (MQ=255) tatcgaaTTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGATGGTGTGGAtatta > 1:2049922‑M2/8‑70 (MQ=255) tcgaaTTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGATGGTGTGGATATTATgg > 1:306621‑M2/6‑71 (MQ=255) cgaaTTGCCTATTTAAACGATCACCTTGTACAGGTAAATGAAGCg < 1:3217537‑M2/41‑1 (MQ=255) cgaaTTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCg < 1:1018159‑M2/41‑1 (MQ=255) gaaTTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGATGGTGTGGAtatta > 1:6751710‑M2/4‑66 (MQ=255) gaaTTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGATGGTGTGGATATTATgggg < 1:2934746‑M2/68‑1 (MQ=255) gaaTTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGACGATGGTGTGGATATTATgggg > 1:5752724‑M2/4‑71 (MQ=255) aaTTGCCTTTTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGATGGTGTGGATATTATgg < 1:791563‑M2/66‑1 (MQ=255) ttGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGcc < 1:5888672/47‑1 (MQ=255) ttGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGcc < 1:5385817/47‑1 (MQ=255) ttGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGcc < 1:890502/47‑1 (MQ=255) | GTCGAGAACGGATTAGGCGCAAAAGACAGCGTTGAAGCGGATGGTTCGATACAGGACGATTATCGAATTGCCTATTTAAACGATCACCTGGTACAGGTAAATGAAGCGATTGCCGATGGTGTGGATATTATGGGG > AP009048/3734057‑3734191 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |