| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 4333023 = | 89 (1.090) | 10 (0.140) | 3/84 | NT | 13.6% | coding (1211/2229 nt) | yjdA | conserved hypothetical protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain |
| ? | AP009048 | 4333056 = | 51 (0.730) | coding (1244/2229 nt) | yjdA | conserved hypothetical protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGG > AP009048/4332986‑4333124 | cAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTc > 1:6155739/1‑71 (MQ=255) aGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCg < 1:2811268/71‑1 (MQ=255) aGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCg < 1:5230558/71‑1 (MQ=255) ttGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGACAATTCAGGCGTTGCTTCATGACGCTTACGCTAACGCCTCGtt < 1:4153812/71‑1 (MQ=255) tgGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGt < 1:936639/70‑1 (MQ=255) tgGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGt < 1:7413045/70‑1 (MQ=255) tgGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTa < 1:324333/71‑1 (MQ=255) tgGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTa < 1:3602625/71‑1 (MQ=255) ggAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATg < 1:2193343/71‑1 (MQ=255) aaGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGct < 1:1729766/71‑1 (MQ=255) cGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCg < 1:3898662/70‑1 (MQ=255) gCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTa > 1:3089826/1‑60 (MQ=255) gCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTa > 1:3299947/1‑60 (MQ=255) gCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGa < 1:1758851/70‑1 (MQ=255) gTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTg > 1:1905283/1‑71 (MQ=255) ttCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGc > 1:4481006/1‑71 (MQ=255) ttCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGc < 1:4411885/71‑1 (MQ=255) ttCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGc < 1:2358838/71‑1 (MQ=255) cGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGcc < 1:4185762/70‑1 (MQ=255) cGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGcc < 1:6901806/70‑1 (MQ=255) cAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCa > 1:1229998/1‑71 (MQ=255) aGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCg < 1:7931518/58‑1 (MQ=255) gCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCg < 1:6365033/57‑1 (MQ=255) ccAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATa > 1:3627662/1‑70 (MQ=255) ccAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATa > 1:7543148/1‑70 (MQ=255) cAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATaaa > 1:4538241/1‑71 (MQ=255) cAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATaaa > 1:2240885/1‑71 (MQ=255) cAATTCAGGAGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATaaa > 1:660780/1‑71 (MQ=255) aaTTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATaaa > 1:4229963/1‑70 (MQ=255) ttCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTg > 1:1680950/1‑71 (MQ=255) ttCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTg > 1:4827490/1‑71 (MQ=255) ttCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTg > 1:3548813/1‑71 (MQ=255) tCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGct > 1:5607688/1‑46 (MQ=255) tCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGct > 1:1731692/1‑46 (MQ=255) cAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGt < 1:5498746/70‑1 (MQ=255) AGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTg > 1:7356850‑M1/1‑71 (MQ=255) gcgttagcgtaagcggcatgaagcaacgcctCGTTGTATGCTCTGCGa > 1:1401416‑M2/32‑48 (MQ=255) gcgttagcgtaagcggcatgaagcaacgcctCGTTGTATGCTCTGCGa > 1:1410835‑M2/32‑48 (MQ=255) gcgttagcgtaagcggcatgaagcaacgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGaa > 1:350837‑M2/32‑71 (MQ=255) gcgttagcgtaagcggcatgaagcaacgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGaa > 1:3213534‑M2/32‑71 (MQ=255) gttagcgtaagcggcatgaagcaacgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAAtt < 1:3089139‑M2/42‑1 (MQ=255) gttagcgtaagcggcatgaagcaacgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAAtt < 1:6516048‑M2/42‑1 (MQ=255) gttagcgtaagcggcatgaagcaacgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAAtt < 1:1369602‑M2/42‑1 (MQ=255) GTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGc > 1:703110‑M1/1‑51 (MQ=255) GTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGc > 1:6890528‑M1/1‑51 (MQ=255) GTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAAc < 1:7362781‑M1/62‑1 (MQ=255) GTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAAtt > 1:6537891‑M1/1‑71 (MQ=255) GTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAAt < 1:332642‑M1/70‑1 (MQ=255) TTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGcc > 1:5295581‑M1/1‑51 (MQ=255) TTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGcc > 1:1342455‑M1/1‑51 (MQ=255) tagcgtaagcggcatgaagcaacgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTAc > 1:5900327‑M2/28‑71 (MQ=255) tagcgtaagcggcatgaagcaacgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTAc > 1:2066120‑M2/28‑71 (MQ=255) tagcgtaagcggcatgaagcaacgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTAc > 1:1266127‑M2/28‑71 (MQ=255) gCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATg > 1:3538701/1‑35 (MQ=255) gCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATg > 1:4594149/1‑35 (MQ=255) tCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTg > 1:1030631/1‑58 (MQ=255) tCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTAcgcg > 1:5344933/1‑70 (MQ=255) cATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCg < 1:1672594/38‑1 (MQ=255) cATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCg < 1:4595520/38‑1 (MQ=255) cATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCg < 1:254581/38‑1 (MQ=255) cATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTAcgcg > 1:574127/1‑69 (MQ=255) cATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTAcgcg > 1:6627374/1‑69 (MQ=255) cATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTAcgcg < 1:295646/69‑1 (MQ=255) cATGCAGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTAcgcg < 1:6673788/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCgcag < 1:6898568/71‑1 (MQ=255) tGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACt > 1:3730485/1‑54 (MQ=255) gCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCgcag > 1:58307/1‑69 (MQ=255) ccGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCgca < 1:3396973/67‑1 (MQ=255) gCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGgc > 1:7352146/1‑71 (MQ=255) cTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGgcg > 1:1522361/1‑71 (MQ=255) cTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGgcg < 1:1349300/71‑1 (MQ=255) cTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGgcg > 1:4378020/1‑71 (MQ=255) aCGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTAc > 1:6955420/1‑56 (MQ=255) aCGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTAc > 1:6946591/1‑56 (MQ=255) aCGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTAc > 1:1982710/1‑56 (MQ=255) aCGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTAc > 1:3098257/1‑56 (MQ=255) aCGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCgg > 1:7487775/1‑71 (MQ=255) cGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGaa > 1:2454755/1‑51 (MQ=255) cGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGgcgc < 1:1486621/68‑1 (MQ=255) gCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGaa > 1:7134211/1‑50 (MQ=255) gCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGaa > 1:1217106/1‑50 (MQ=255) gCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGaa > 1:3394916/1‑50 (MQ=255) gCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCAGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGa < 1:4323419/71‑1 (MQ=255) cTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGaa < 1:662100/71‑1 (MQ=255) cTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGaa < 1:3504172/71‑1 (MQ=255) aacgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCAt > 1:5523216‑M2/8‑36 (MQ=255) aacgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCggg > 1:6574024‑M2/8‑67 (MQ=255) aacgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCggg > 1:3495482‑M2/8‑67 (MQ=255) acgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAAt < 1:6379459‑M2/63‑1 (MQ=255) acgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATAc < 1:723357‑M2/65‑1 (MQ=255) acgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATAc < 1:2054499‑M2/65‑1 (MQ=255) acgcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATAc < 1:7610938‑M2/65‑1 (MQ=255) gcctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCt < 1:2086705‑M2/67‑1 (MQ=255) cctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTg < 1:4085262‑M2/68‑1 (MQ=255) ctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTgg < 1:7195373‑M2/69‑1 (MQ=255) ctCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTg > 1:5771577‑M2/3‑70 (MQ=255) tCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGaa < 1:2716950‑M2/40‑1 (MQ=255) tCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGaa < 1:7746359‑M2/40‑1 (MQ=255) tCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGaa < 1:5770230‑M2/40‑1 (MQ=255) cGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGaa < 1:4309290/40‑1 (MQ=255) | CAGTTGTGGGAAGATTCGCTGTTCGCCCAGCCAATTCAGGCGTTGCTTCATGCCGCTTACGCTAACGCCTCGTTGTATGCTCTGCGATCTGCCGCGCATAAACTGTTGAATTACGCGCAGCAGGCGCGGGAATACCTGG > AP009048/4332986‑4333124 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |