| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 176281 | 54 (0.880) | 8 (0.160) +GGGACTGGTG |
3/78 | NT | 16.5% | coding (911/1353 nt) | yaeL | zinc metallopeptidase |
| ? | Exported | 1481436 = | 48 (0.780) | coding (1238/1629 nt) | glpA | sn‑glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase (anaerobic), large subunit, FAD/NAD(P)‑binding | |||||
GTCCCTTGTCTTTGACATTAATCCCGGAGAGTAAACCGGGTAATGGTAAAGCGATTGGTTTTGTCGGTATTGAGCCGAAAGTCATTCCTTTGCCAGATGAGTATAAAGTTGTACGCCAGTATGGGCCGTTCAACGCCAT > Exported/176212‑176350 | gTCCCTTGTCTTTGACATTAATCCCGGAGAGTAAACCGGGTAATGGTAAAGCGATTGGTTTTGTCGGTAtt < 1:659705/71‑1 (MQ=255) ccTTGTCTTTGACATTAATCCCGGAGAGTAAACCGGGTAATGGTAAAGCGATTGGTTTTGTCGGTATTGa < 1:3596309/70‑1 (MQ=255) ttGTCTTTGACATTAATCCCGGAGAGTAAACCGGGTAATGGTAAAGCGATTGGTTTTGTCGGTATTGAGcc > 1:122110/1‑71 (MQ=255) tGTCTTTGACATTAATCCCGGAGAGTAAACCGGGTAATGGTAAAGCGATTGGTTTTGTCGGTATTGAGcc > 1:3171343/1‑70 (MQ=255) tCTTTGACATTAATCCCGGAGAGTAAACCGGGTAATGGTAAAGCGATTGGTTTTGTCGGTATTGAGCCGa < 1:3918847/70‑1 (MQ=255) tttGACATTAATCCCGGAGAGTAAACCGGGTAATGGTAAAGCGATTGGTTTTGTCGGTATTGAGCCGAAAg > 1:2411515/1‑71 (MQ=255) tGACATTAATCCCGGAGAGTAAACCGGGTAATGGTAAAGCGATTGGTTTTGTCGGTATTGAGCCGAAAGt > 1:5679585/1‑70 (MQ=255) tGACATTAATCCCGGAGAGTAAACCGGGTAATGGTAAAGCGATTGGTTTTGTCGGTATTGAGCCGAAAGt > 1:1991967/1‑70 (MQ=255) 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ttGGTTTTGTCGGTATTGAGCCGAAAGTCATTCCTTTGCCAGAt < 1:4329044/44‑1 (MQ=255) ggTTTTGTCGGTATgggactggtgatcgtcatggcgat > 1:2840380‑M1/1‑14 (MQ=255) ggTTTTGTCGGTATgggactggtgatcgtcatggcgat > 1:3505316‑M1/1‑14 (MQ=255) ggTTTTGTCGGTATgggactggtgatcgtcatggcgat > 1:1282339‑M1/1‑14 (MQ=255) ggTTTTGTCGGTATgggactggtgatcgtcatggcgat > 1:3722969‑M1/1‑14 (MQ=255) ggTTTTGTCGGTATgggactggtgatcgtcatggcgat > 1:597921‑M1/1‑14 (MQ=255) ggTTTTGTCGGTATTTAGCCGAAAGTCATTCCTTTGCCAGATGAGTATAAAGTTGTACGCCAGTATGGGc < 1:5073935/70‑1 (MQ=255) ggTTTTGTCGGTATTGAGCCGAAAGTCATTCCTTTGCCAGATGAGTATAAAGTTGTACGCCAGTATGGGc < 1:2745155/70‑1 (MQ=255) ttttGTCGGTATTGAGCCGAAAGTCATTCCTTTGCCAGAt < 1:665330/40‑1 (MQ=255) ttttGTCGGTATTGAGCCGAAAGTCATTCCTTTGCCAGATGAGTATAAAGTTGTACGCCa < 1:144109/60‑1 (MQ=255) tttGTCGGTATTGAGCCGAAAGTCATTCCTTTGCCAGATGAGTATAAAGTTGTACGCCAGTATGGGCCGtt > 1:4562659/1‑71 (MQ=255) tttGTCGGTATTGAGACGAAAGTCATTCCTTTGCCAGATGAGTATAAAGTTGTACGCCa < 1:4022103/59‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |