| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 369453 = | 61 (0.990) | 6 (0.130) +TGTGCGGCCGTC |
3/74 | NT | 12.8% | coding (400/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| ? | Exported | = 425443 | 48 (0.780) | coding (610/1149 nt) | nagA | N‑acetylglucosamine‑6‑phosphate deacetylase | |||||
AGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGATGGCTTTAGTTTCCCGGCCATTACCCGCCAGATCGCCAATATT > Exported/369390‑369521 | aGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTa > 1:1241683/1‑71 (MQ=255) cGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTAt > 1:1239499/1‑70 (MQ=255) cGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATc < 1:5058258/71‑1 (MQ=255) gTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATc < 1:1761212/60‑1 (MQ=255) gTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATc < 1:885467/60‑1 (MQ=255) tAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCAc > 1:3241471/1‑70 (MQ=255) aaCCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTAt > 1:1845064/1‑65 (MQ=255) aaCCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCAt > 1:3602701/1‑71 (MQ=255) ccACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCAttt < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |