| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 436259 = | 55 (0.900) | 69 (1.230) | 42/90 | NT | 61.5% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | Exported | = 2706018 | 36 (0.640) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
GAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATT > Exported/436189‑436329 | gcacacgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa > 1:2374885‑M1/71‑71 (MQ=255) cacgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacctgcgaaaaaataAtt > 1:2229201‑M1/68‑70 (MQ=255) cacgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc < 1:1091062‑M1/4‑1 (MQ=255) tttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCa < 1:4574976/70‑1 (MQ=255) cgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc < 1:4153582‑M1/4‑1 (MQ=255) gtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGc < 1:5462317‑M1/7‑1 (MQ=255) taaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacacgcgaaaaaataATTCAGc < 1:4190821‑M1/7‑1 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt < 1:551157‑M1/8‑1 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgccaaaaaataAATCAGCt < 1:522646‑M1/8‑1 (MQ=255) ggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGaca < 1:4704130‑M1/14‑1 (MQ=255) aGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGaca < 1:586454/71‑1 (MQ=255) ccAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTaa > 1:1681267/1‑65 (MQ=255) ccAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcact < 1:2840805/71‑1 (MQ=255) cAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactg > 1:2582880/1‑71 (MQ=255) gacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCt > 1:7882‑M1/54‑61 (MQ=255) aGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTAt < 1:1807081/55‑1 (MQ=255) acgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa > 1:3919767‑M1/53‑53 (MQ=255) gCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa > 1:5472977/1‑52 (MQ=255) gCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa > 1:2946310/1‑52 (MQ=255) cgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa < 1:602849‑M1/10‑1 (MQ=255) cgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcac < 1:3589664‑M1/20‑1 (MQ=255) actgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcactg < 1:1523699‑M1/22‑1 (MQ=255) actgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:2317434‑M1/49‑70 (MQ=255) actgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTgg > 1:3945897‑M1/49‑71 (MQ=255) gACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTAtt > 1:1472604/1‑50 (MQ=255) gACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg < 1:1608266/69‑1 (MQ=255) tgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataat > 1:4729129‑M1/47‑48 (MQ=255) aCGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcac < 1:1644314/66‑1 (MQ=255) gctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTa < 1:5181717‑M1/9‑1 (MQ=255) cGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa > 1:173989/1‑57 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gCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGCCACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc > 1:3781120/1‑71 (MQ=255) ccGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACg < 1:5691793/71‑1 (MQ=255) caaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgca < 1:1174524‑M1/19‑1 (MQ=255) cGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGa < 1:201044/71‑1 (MQ=255) ggATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGacac > 1:2918079/1‑45 (MQ=255) ccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAg < 1:65558‑M1/6‑1 (MQ=255) tATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt > 1:4015514/1‑71 (MQ=255) tATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt > 1:5644267/1‑71 (MQ=255) tATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt > 1:2788780/1‑71 (MQ=255) gagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgc < 1:1823210‑M1/18‑1 (MQ=255) gtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt > 1:3486955‑M1/24‑70 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAtt > 1:3501032‑M1/23‑63 (MQ=255) tcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAtt > 1:4103991‑M1/23‑63 (MQ=255) cATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:3154273/1‑71 (MQ=255) gtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:3840751‑M1/50‑1 (MQ=255) atatACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:3001056/1‑70 (MQ=255) tttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatga > 1:3344235‑M1/20‑71 (MQ=255) tataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg < 1:3407266/41‑1 (MQ=255) tataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg < 1:2717940/41‑1 (MQ=255) ttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:3624652‑M1/53‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAAc < 1:3267948‑M1/37‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:2433878‑M1/53‑1 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat < 1:5311352‑M1/53‑1 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTgg > 1:2184296/1‑40 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg < 1:734551/71‑1 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat > 1:2686407/1‑70 (MQ=255) cacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg < 1:5025370‑M1/54‑1 (MQ=255) aCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcact > 1:4655127/1‑37 (MQ=255) cTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa < 1:3798542/71‑1 (MQ=255) cTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:1686461/1‑71 (MQ=255) cTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:1292915/1‑71 (MQ=255) tCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg < 1:5184704/68‑1 (MQ=255) ccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAAct < 1:4892933‑M1/58‑1 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAg < 1:4989526‑M1/45‑1 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAg < 1:2651418‑M1/45‑1 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActc > 1:1973714‑M1/13‑71 (MQ=255) cTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGAtt < 1:1720271/53‑1 (MQ=255) cTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActc < 1:2938578/71‑1 (MQ=255) cTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActc < 1:5146861/71‑1 (MQ=255) tGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:5471789/61‑1 (MQ=255) tGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat < 1:2224487/61‑1 (MQ=255) cgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:4083097‑M1/11‑71 (MQ=255) gaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt < 1:4407020‑M1/46‑1 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGa > 1:694373‑M1/8‑40 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatga < 1:1004913‑M1/55‑1 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa < 1:1205012‑M1/56‑1 (MQ=255) aaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAg < 1:2543111‑M1/64‑1 (MQ=255) aaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa > 1:4043589‑M1/6‑39 (MQ=255) aaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc < 1:885978‑M1/65‑1 (MQ=255) ttGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt > 1:2320166/1‑51 (MQ=255) ttGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGtt > 1:1997640/1‑51 (MQ=255) ttGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:4477734/1‑71 (MQ=255) ttGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCt > 1:4390607/1‑70 (MQ=255) ataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtat > 1:1910750‑M1/4‑71 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa < 1:4506241‑M1/61‑1 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtata < 1:1883613‑M1/69‑1 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtata > 1:1587514‑M1/3‑71 (MQ=255) taATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCtata > 1:2158631‑M1/3‑71 (MQ=255) gTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:130999/1‑58 (MQ=255) aATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatga < 1:3767513‑M1/52‑1 (MQ=255) | GAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATT > Exported/436189‑436329 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |