| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 15385 = | 45 (0.730) | 36 (0.600) | 20/96 | NT | 56.7% | intergenic (+87/+60) | dnaJ/mokC | chaperone Hsp40, co‑chaperone with DnaK/regulatory protein for HokC, overlaps CDS of hokC |
| ? | Exported | = 1570889 | 11 (0.180) | intergenic (+26/+210) | nupC/alaX | nucleoside (except guanosine) transporter/tRNA‑Ala | |||||
CTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAGAGTACACTACTCTCACTGATCGGGGTTTTCAGGCACACAAATAATAAGTTTATTCGCATCGC > Exported/1570819‑1570953 | cTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATa < 1:2222773/71‑1 (MQ=255) tGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAa < 1:2314758‑M2/71‑2 (MQ=255) gTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAa > 1:3133798‑M2/1‑68 (MQ=255) gTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAa > 1:1989073‑M2/1‑68 (MQ=255) gtgtGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattccca > 1:943614‑M2/1‑64 (MQ=255) tgtgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattccca < 1:257710‑M2/70‑8 (MQ=255) tgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAGAGTacac > 1:3381494/1‑70 (MQ=255) gTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAGAGTACACTActc > 1:642881/1‑71 (MQ=255) cTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgct < 1:4305534‑M2/70‑16 (MQ=255) tGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgct > 1:4033767‑M2/1‑54 (MQ=255) aaTCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAa < 1:3634595‑M2/49‑2 (MQ=255) aTCGCAGGACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgcta > 1:2688484‑M2/1‑47 (MQ=255) tCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAGAGTa < 1:1976676/52‑1 (MQ=255) cGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggt < 1:3546389‑M2/71‑27 (MQ=255) cGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAaga > 1:4527209/1‑48 (MQ=255) gcagcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAGAGTACACTACTCTCACTGATCggg < 1:5211922/70‑1 (MQ=255) agcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAGAGTACACTACTCTCACTGATCGGGGtt < 1:4538297/71‑1 (MQ=255) ggTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAGAGTaca > 1:4964655/1‑44 (MQ=255) tGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtat > 1:3267779‑M2/1‑34 (MQ=255) gTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgct > 1:678103‑M2/1‑30 (MQ=255) tAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaa > 1:3175185‑M2/1‑29 (MQ=255) tAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaa > 1:121242‑M2/1‑29 (MQ=255) tAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaa < 1:1919232‑M2/46‑18 (MQ=255) aGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctga < 1:3920470‑M2/70‑44 (MQ=255) aGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataa < 1:4792338‑M2/37‑11 (MQ=255) aGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataa < 1:943248‑M2/37‑11 (MQ=255) aGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAGAGTACACTACTCTCACTGATCGGGGTTTTCAGGCACACaaa > 1:2878483/1‑70 (MQ=255) aGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAGAGTACACTACTCTCACTGATCGGGGTTTTCAGGCACACaaa < 1:2620006/70‑1 (MQ=255) gACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgata > 1:430829‑M2/1‑26 (MQ=255) gACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgata > 1:3729055‑M2/1‑26 (MQ=255) gACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAattcccataag > 1:1566550‑M2/1‑26 (MQ=255) catacataAAAAAGCCGGGGATAAGAGTACACTACTCTCACTGATCGGGGTTTTCa < 1:1593293/56‑1 (MQ=255) tacataAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgcta > 1:2993137‑M2/1‑21 (MQ=255) tacataAAAAAGCCGGGGATAAGAGTACACTACTCTCACTGATCGGGGTTTTCAGGCACACAAATAATAAg > 1:4815408/1‑71 (MQ=255) acataAAAAAGCCGGGGATAAGAGTACACTACTCTCa < 1:2011809/37‑1 (MQ=255) cataAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattta > 1:2844822‑M2/1‑19 (MQ=255) cataAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattta > 1:2926393‑M2/1‑19 (MQ=255) cataAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattt < 1:1844446‑M2/70‑52 (MQ=255) cataAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattt < 1:2832823‑M2/70‑52 (MQ=255) ataAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtat > 1:4492979‑M2/1‑18 (MQ=255) taAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaac > 1:2924584‑M2/1‑17 (MQ=255) taAAAAAGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaac > 1:728401‑M2/1‑17 (MQ=255) aaaaaGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtat > 1:2929129‑M2/1‑15 (MQ=255) aaaaaGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgt < 1:4050221‑M2/44‑30 (MQ=255) aaaaGCCGGGGATAAGAGTACACTACTCTCACTGATCGGGGTTTTCAGGCACACAAATAATAAGTTTATTc < 1:297631/71‑1 (MQ=255) aaaGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaatgtgc > 1:2164116‑M2/1‑13 (MQ=255) aaaGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgata > 1:4279325‑M2/1‑13 (MQ=255) aaaGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgata > 1:3117963‑M2/1‑13 (MQ=255) aaGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgcc > 1:2920698‑M2/1‑12 (MQ=255) aaGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgcc > 1:3586730‑M2/1‑12 (MQ=255) aaGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtatt > 1:1553901‑M2/1‑12 (MQ=255) aaGCCGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtatt > 1:2420322‑M2/1‑12 (MQ=255) ccGGGGATAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgagccgat < 1:4117568‑M2/71‑63 (MQ=255) cGGGGAGTaatcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatg > 1:4819287‑M2/1‑8 (MQ=255) gATAAGAGTACACTACTCTCACTGATCGGGGTTTTCAGGCACACAAATAATAAGTTTATTCGCATcgc > 1:390296/1‑68 (MQ=255) aTAattcccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga < 1:3708574‑M2/51‑49 (MQ=255) | CTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAGAGTACACTACTCTCACTGATCGGGGTTTTCAGGCACACAAATAATAAGTTTATTCGCATCGC > Exported/1570819‑1570953 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |