| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 2303886 | 49 (0.800) | 24 (0.570) | 9/68 | NT | 35.9% | intergenic (+59/‑125) | metJ/yiiX | DNA‑binding transcriptional repressor, S‑adenosylmethionine‑binding/predicted peptidoglycan peptidase |
| ? | Exported | 2925754 = | 52 (1.230) | intergenic (‑90/+70) | holC/pepA | DNA polymerase III, chi subunit/aminopeptidase A, a cyteinylglycinase | |||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GATTTAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGCCTGACGCAAT > Exported/2925685‑2925824 | tttAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGtt < 1:1126658/71‑1 (MQ=255) tttAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGtt < 1:306040/71‑1 (MQ=255) tttAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGtt < 1:4147846/71‑1 (MQ=255) tttAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGtt < 1:4260563/71‑1 (MQ=255) ttAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGtt > 1:2767655/1‑70 (MQ=255) ttAAATACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGtt > 1:2436282/1‑70 (MQ=255) aaaTACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAg > 1:3344555/1‑71 (MQ=255) aaTACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCa < 1:4361402/69‑1 (MQ=255) aaTACGCATCAGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAg < 1:183389/70‑1 (MQ=255) aGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGT‑‑GTa > 1:1670600/1‑69 (MQ=255) aGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAgg > 1:3317544/1‑71 (MQ=255) aGGTATACACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAgg > 1:3846808/1‑71 (MQ=255) ataCACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAGGTCg > 1:1273586/1‑70 (MQ=255) taCACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAGGTCGGa < 1:767328/71‑1 (MQ=255) taCACCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAGGTCGGa < 1:210658/71‑1 (MQ=255) cacCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAGGTCGGAt > 1:5343328/1‑70 (MQ=255) cacCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAGGTCGGAt < 1:1314499/70‑1 (MQ=255) cacCGCAGCGCCTGATGCGACGCTGTTGTGTCTTATCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAGGTCGGAt > 1:1518991/1‑70 (MQ=255) 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1:5583384‑M2/15‑40 (MQ=255) ttatcaggcctacgAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAGGTCGGATaa > 1:1171725‑M2/15‑40 (MQ=255) aTCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTCTACGTAGGCCGGATaa > 1:3305296/1‑40 (MQ=16) aTCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTCTACGTAGGCCGGATAAGGCGtt < 1:4962770/46‑1 (MQ=12) aTCAGGCCTACGAGTTCAGTGCTCTACGTAGGCCGGATAAGGCGtt < 1:1028943/46‑1 (MQ=12) tcaggcctacgAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc < 1:765018‑M2/47‑1 (MQ=255) tcaggcctacgAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc < 1:2927832‑M2/47‑1 (MQ=255) tcaggcctacgAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTg < 1:1496778‑M2/60‑1 (MQ=255) tcaggcctacgAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTg < 1:3019297‑M2/60‑1 (MQ=255) caggcctacgAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGc > 1:1660041‑M2/11‑71 (MQ=255) caggcctacgAGTTCAGTGCTGT‑‑GTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAACAGCCTTGc > 1:5031944‑M2/11‑71 (MQ=255) cAGGCCTACGAGTTCAGTGCTCTACGTAGGCCGGATAAGGCGtt < 1:349833/44‑1 (MQ=12) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |