| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | Exported | 983,531 | A→C | 13.7% | intergenic (+443/‑125) | ydfC → / → dicB | hypothetical protein/cell division inhibition protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | Exported | 983,531 | 0 | A | C | 13.7% | 109.3 / 14.2 | 51 | intergenic (+443/‑125) | ydfC/dicB | hypothetical protein/cell division inhibition protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (19/25); new base C (2/5); total (21/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.85e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.45e-01 | |||||||||||
CGTGACTGCTCTGCCGCCCTTTTTAAAGTGAATTTTGTGATGTGGTGAATGCGGCTGAGCGCACGCGGAACAGTTAAAACCAAAAACAGTGTTATGGGTGGATTCTCTGTATCCGGCGTTAATTGTTAACTGGTTAACG > Exported/983463‑983601 | cGTGACTGCTCTGCCGCCCTTTTTAAAGTGAATTTTGTGATGTGGTGAATGCGGCTGAGCGCACGCGGaa > 1:3093459/1‑70 (MQ=255) tGACTGCTCTGCCGCCCTTTTTAAAGTGAATTTTGTGATGTGGTGAATGCGGCTGAGCGCACGCGGAACAg > 1:3683709/1‑71 (MQ=255) aCTGCTCTGCCGCCCTTTTTAAAGTGAATTTTGTGATGTGGTGAATGCGGCTGAGCGCACGCGGAACAGt > 1:3041768/1‑70 (MQ=255) ctctGCCGCCCTTTTTAAAGTGAATTTTGTGATGTGGTGAATGCGGCTGAGCGCACGCGGAACAGTTaaaa > 1:44310/1‑71 (MQ=255) ctGCCGCCCTTTTTAAAGTGAATTTTGTGATGTGGTGAATGCGGCTGAGCGCACGCGGAACAGTTAAAAc > 1:3472261/1‑70 (MQ=255) ccgccCTTTTTAAAGTGAATTTTGTGATGTGGTGAATGCGGCTGAGCGCACGCGGAACAGTTAAAACCaaa < 1:701072/71‑1 (MQ=255) gccCTTTTTAAAGTGAATTTTGTGATGTGGTGAATGCGGCTGAGCGCACGCGGAACAGTTAAAACCaaaaa > 1:3810154/1‑71 (MQ=255) gccCTTTTTAAAGTGAATTTTGTGATGTGGTGAATGCGGCTGAGCGCACGCGGAACAGTTAAAACCaaaaa > 1:2859085/1‑71 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |