| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 242249 | 95 (1.300) | 9 (0.130) | 3/92 | NT | 9.0% | coding (1974/3147 nt) | sbcC | exonuclease, dsDNA, ATP‑dependent |
| ? | Exported | = 242319 | 92 (1.310) | coding (1904/3147 nt) | sbcC | exonuclease, dsDNA, ATP‑dependent | |||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
TGTCAGTGCATAACCCGTCAATGTCGTTAAAAGTAGTTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGATAATTTGCTGATTATGCGCGGCAATCTGCCCTTGTAATTCATGCCGTTGGCTGAGTAACCG > Exported/242255‑242386 | tGTCAGTGCATAACCCGTCAATGTCGTTAAAAGTAGTTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGa > 1:1122360/1‑71 (MQ=255)tGTCAGTGCATAACCCGTCAATGTCGTTAAAAGTAGTTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGa > 1:2441286/1‑71 (MQ=255)tGTCAGTGCATAACCCGTCAATGTCGTTAAAAGTAGTTGCTGGCGTTGTCCAATTTGCTGTTGATACTGGa > 1:4025691/1‑71 (MQ=255) tCAGTGCATAACCCGTCAATGTCGTTAAAAGTAGTTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGAt > 1:3077336/1‑70 (MQ=255) tCAGTGCATAACCCGTCAATGTCGTTAAAAGTAGTTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGAt < 1:3249966/70‑1 (MQ=255) tCAGTGCATAACCCGTCAATGTCGTTAAAAGTAGTTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGAt < 1:3964495/70‑1 (MQ=255) tGCATAACCCGTCAATGTCGTTAAAAGTAGTTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGATAAttt > 1:2620795/1‑71 (MQ=255) cATAACCCGTCAATGTCGTTAAAAGTAGTTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGATAATTTGc > 1:2867598/1‑71 (MQ=255) 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aaaGTAGTTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTgg < 1:2907177/41‑1 (MQ=255) aaaGTAGTTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTgg < 1:3913248/41‑1 (MQ=255) aaaGTAGTTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTgg < 1:5097072/41‑1 (MQ=255) aaaGTAGTTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTgg < 1:929476/41‑1 (MQ=255) agtagtTGCTGGCGTTGTTCAATTTGATGTTGATACTGGATAATTTGCTGATTATGcgcg > 1:1002731/1‑60 (MQ=255) gtagtTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGATAAttt < 1:108803/45‑1 (MQ=255) gtagtTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGATAAttt < 1:1895355/45‑1 (MQ=255) gtagtTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGATAAttt < 1:2329961/45‑1 (MQ=255) gtagtTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGATAAttt < 1:2933256/45‑1 (MQ=255) gtagtTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGATAAttt < 1:1591055/45‑1 (MQ=255) gtagtTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGATAATTTGCTGATTATgcgc < 1:1314829/58‑1 (MQ=255) gtagtTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGATAATTTGCTGATTATgcgc < 1:4000507/58‑1 (MQ=255) gtagtTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGATAATTTGCTGATTATgc < 1:964245/56‑1 (MQ=255) 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TGTCAGTGCATAACCCGTCAATGTCGTTAAAAGTAGTTGCTGGCGTTGTTCAATTTGCTGTTGATACTGGATAATTTGCTGATTATGCGCGGCAATCTGCCCTTGTAATTCATGCCGTTGGCTGAGTAACCG > Exported/242255‑242386 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |