| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 436259 = | 70 (0.950) | 342 (5.090) | 62/88 | NT | 87.6% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | Exported | = 2706018 | 33 (0.490) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 474 total aligned reads displayed.
GCACACGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAATTCTCAAGGAGAAGCGGATGAAACAGTATTTGATTGCCCCCTCAATTCTGTCGGCTGATTTTGCCC > Exported/2705949‑2706085 | acacGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAaata < 1:2107401/68‑1 (MQ=255) cacGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattc > 1:2380730‑M2/1‑67 (MQ=255) cacGTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAa < 1:2815444‑M2/68‑2 (MQ=255) gTAAAAAGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcag < 1:3971136‑M2/70‑7 (MQ=255) aaaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaa > 1:4598916‑M2/1‑61 (MQ=255) aaaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaa > 1:4097675‑M2/1‑61 (MQ=255) aaaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagct > 1:2758449‑M2/1‑60 (MQ=255) aaGGTGGACGAACTGCTGGCTTTGTACAAACCAGGAGTCGTTTCACCCGCGAAAAAATAattcagctaaga > 1:3625773‑M2/1‑59 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |