| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 381043 = | NA (NA) | 4 (0.090) | 3/88 | NT | NA | coding (146/906 nt) | insD | IS2 insertion element transposase InsAB' |
| ? | AP009048 | 381065 = | NA (NA) | coding (168/906 nt) | insD | IS2 insertion element transposase InsAB' | |||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
CAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/381119‑381043‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccgtatACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCA > AP009048/381065‑381134 CAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACAT < 1:482452/71‑1CAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACAT < 1:3420544/71‑1 AGCGCCCATACCCGACGATAAGCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATC > 1:928132/1‑71 AGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATC > 1:2535664/1‑71 AGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATC > 1:4046252/1‑71 AGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATC < 1:2817475/71‑1 GCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC < 1:962382/71‑1 GCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC < 1:2284050/71‑1 GCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC < 1:495587/71‑1 GCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC > 1:4094710/1‑71 GCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC < 1:2648311/71‑1 CGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCG < 1:2215821/71‑1 CGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCG < 1:2316644/71‑1 CGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCG < 1:423258/71‑1 CGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC < 1:3823836/70‑1 CGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACAT < 1:1883028/68‑1 GCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCG > 1:3280997/1‑70 GCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACACCCG > 1:1721255/1‑70 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CATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT > 1:2273179/1‑70 TACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGT < 1:1317148/66‑1 TACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC > 1:1840578/1‑64 ACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTA > 1:2794095/1‑66 CCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTA > 1:3190824/1‑65 CCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGT < 1:1599800/63‑1 CGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGT < 1:2466985/62‑1 GACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC > 1:4130539/1‑59 GACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATC > 1:2010230/1‑58 ATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACAT > 1:4230737/1‑53 AACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTA > 1:587918/1‑56 TCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGT < 1:2312714/38‑1 TCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTA > 1:889235/1‑37 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AP009048/381119‑381043‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccgtatACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCA > AP009048/381065‑381134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |