| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 436833 | 83 (1.360) | 107 (1.750) | 41/100 | NT | 57.1% | coding (546/546 nt) | seqA | regulatory protein for replication initiation |
| ? | Exported | 1803907 = | 78 (1.270) | intergenic (+63/‑28) | ygaH/mprA | predicted inner membrane protein/DNA‑binding transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
ATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATTT > Exported/1803841‑1803976 | gaacacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGc < 1:527515‑M2/4‑1 (MQ=255) acacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa < 1:1924941‑M2/7‑1 (MQ=255) acacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGa < 1:2259134‑M2/7‑1 (MQ=255) aaCCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTg > 1:1835471/1‑70 (MQ=255) cacatcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTg > 1:3315581‑M2/64‑69 (MQ=255) cacaAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAtt < 1:3391155/71‑1 (MQ=255) atcatgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:1214406‑M2/11‑1 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt > 1:533398‑M2/58‑71 (MQ=255) atgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt > 1:377851‑M2/58‑71 (MQ=255) aaGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTaa > 1:1516433/1‑70 (MQ=255) aaGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAAt > 1:1763860/1‑71 (MQ=255) aaGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAAt > 1:187589/1‑71 (MQ=255) aaGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAAt > 1:2093839/1‑71 (MQ=255) aaGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAAt > 1:2618605/1‑71 (MQ=255) tgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAAt > 1:3458889‑M2/57‑70 (MQ=255) tgcagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATg < 1:960271‑M2/15‑1 (MQ=255) cagtcgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatataaCGGCTGAAATTAATGAg > 1:395313‑M2/55‑71 (MQ=255) aaTCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAg > 1:1063574/1‑71 (MQ=255) cgatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTaa > 1:83460‑M2/51‑63 (MQ=255) aTTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAAt > 1:1505719/1‑64 (MQ=255) aTTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCa > 1:1128693/1‑71 (MQ=255) gatgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:3143525‑M2/19‑1 (MQ=255) atgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:1564592‑M2/11‑1 (MQ=255) atgcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAAtt < 1:2286212‑M2/11‑1 (MQ=255) tttCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAc > 1:2507856/1‑71 (MQ=255) gcaattcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTa > 1:1112337‑M2/47‑58 (MQ=255) tCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAcc > 1:1375910/1‑70 (MQ=255) tCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAcc > 1:64373/1‑70 (MQ=255) tAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa > 1:408513/1‑70 (MQ=255) attcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaa < 1:212049‑M2/28‑1 (MQ=255) attcccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatcgaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa > 1:3769061‑M2/44‑70 (MQ=255) cccggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg > 1:1717295‑M2/41‑71 (MQ=255) ggcggaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGa > 1:2324798‑M2/38‑70 (MQ=255) tACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg > 1:3854631/1‑66 (MQ=255) tACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATg > 1:2720791/1‑66 (MQ=255) gaattgattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGtt < 1:2671198‑M2/38‑1 (MQ=255) aTTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAAtt < 1:2557418/43‑1 (MQ=255) tttACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGtt < 1:2179020/69‑1 (MQ=255) tACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGaaa > 1:2449360/1‑38 (MQ=255) tACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGaaa > 1:2569261/1‑38 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:242630‑M2/42‑1 (MQ=255) gattgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt > 1:914757‑M2/29‑70 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:2547933/47‑1 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:708857/70‑1 (MQ=255) aCTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:918671/70‑1 (MQ=255) attgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaa < 1:2400813‑M2/28‑1 (MQ=255) ttgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:3351195‑M2/19‑1 (MQ=255) ttgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:1224956‑M2/19‑1 (MQ=255) ttgagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:752206‑M2/19‑1 (MQ=255) ttATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaa > 1:3190499/1‑53 (MQ=255) tATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:1898068/1‑53 (MQ=255) gagaaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCAt < 1:1186313‑M2/22‑1 (MQ=255) tttGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGccc < 1:253127/71‑1 (MQ=255) aaggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATg < 1:14247‑M2/15‑1 (MQ=255) aggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:1775330‑M2/21‑49 (MQ=255) aggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCaaa > 1:166580‑M2/21‑49 (MQ=255) aggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAt > 1:202759‑M2/21‑71 (MQ=255) ggtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAtt > 1:1174180‑M2/20‑71 (MQ=255) gTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATa < 1:3737466/42‑1 (MQ=255) gTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATa < 1:159044/42‑1 (MQ=255) tCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:2930742/37‑1 (MQ=255) tCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:856173/37‑1 (MQ=255) tCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGt < 1:3270008/37‑1 (MQ=255) gtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCg < 1:3166846‑M2/40‑1 (MQ=255) gtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCg < 1:50404‑M2/40‑1 (MQ=255) gtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCa > 1:2652550‑M2/19‑68 (MQ=255) gtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCAt > 1:793070‑M2/19‑69 (MQ=255) gtttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTg < 1:1461888‑M2/53‑1 (MQ=255) tttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:2137724‑M2/27‑1 (MQ=255) tttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:3061069‑M2/27‑1 (MQ=255) tttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:947190‑M2/27‑1 (MQ=255) tttgcggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:806123‑M2/27‑1 (MQ=255) cACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATAcc > 1:2478439/1‑42 (MQ=255) cTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:3165879/57‑1 (MQ=255) cTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:1549569/57‑1 (MQ=255) tGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGtt < 1:772026/56‑1 (MQ=255) gTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAg > 1:1868755/1‑49 (MQ=255) tCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCa < 1:890766/62‑1 (MQ=255) tCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACaaa > 1:2609461/1‑71 (MQ=255) ggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGc < 1:192227‑M2/47‑1 (MQ=255) ggaactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACaaa > 1:583340‑M2/13‑71 (MQ=255) aactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:3762265‑M2/11‑54 (MQ=255) aactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTa > 1:1343049‑M2/11‑54 (MQ=255) aactatctaaCGGCTGAAATTAATGAGCTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATg < 1:1020010‑M2/61‑1 (MQ=255) ctatctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCa < 1:1965403‑M2/27‑1 (MQ=255) aCTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCg < 1:2742079/47‑1 (MQ=255) atctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATgg > 1:474336‑M2/7‑38 (MQ=255) atctaaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATgg > 1:3808395‑M2/7‑38 (MQ=255) tatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt < 1:2340757/71‑1 (MQ=255) tatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt < 1:3698261/71‑1 (MQ=255) tatCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt < 1:2803986/71‑1 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaaaa > 1:2050699‑M2/4‑70 (MQ=255) taaCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt > 1:3656666‑M2/4‑71 (MQ=255) atCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAtt > 1:626137/1‑71 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTaaa < 1:2202139‑M2/66‑1 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAttt < 1:1491006‑M2/70‑1 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAttt < 1:3751492‑M2/70‑1 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt < 1:215768‑M2/68‑1 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt < 1:1985110‑M2/68‑1 (MQ=255) aCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAAt < 1:2905350‑M2/68‑1 (MQ=255) | ATAACCCACAAGAATCATTTTTCTAAAACAATACATTTACTTTATTTGTCACTGTCGTTACTATATCGGCTGAAATTAATGAGGTCATACCCAAATGGATAGTTCGTTTACGCCCATTGAACAAATGCTAAAATTT > Exported/1803841‑1803976 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |