| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 436259 = | 57 (0.770) | 73 (1.080) | 36/92 | NT | 54.8% | intergenic (‑156/‑29) | ybfF/seqA | conserved hypothetical protein/regulatory protein for replication initiation |
| ? | Exported | = 2706018 | 68 (1.010) | coding (836/837 nt) | dam | DNA adenine methylase | |||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
GAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCTATATT > Exported/436189‑436329 | gcacacgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa < 1:3362968‑M1/1‑1 (MQ=255)gcacacgtaaaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataa < 1:3737365‑M1/1‑1 (MQ=255)gAGTTTTTCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa > 1:223457/1‑71 (MQ=255) tttCTGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAg > 1:4158537/1‑71 (MQ=255) tGCAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTa < 1:957279/62‑1 (MQ=255) aaaaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGc < 1:4286129‑M1/7‑1 (MQ=255) cAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTa < 1:4251747/68‑1 (MQ=255) cAAGCCAGGCTTGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa < 1:2652609/71‑1 (MQ=255) cAAGCCAGGCTAGACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGa < 1:503415/71‑1 (MQ=255) aaggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTaa < 1:2510410‑M1/10‑1 (MQ=255) aggtggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGac > 1:207503‑M1/59‑71 (MQ=255) ggacgaactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGc < 1:4720028‑M1/7‑1 (MQ=255) aactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:2879314‑M1/50‑71 (MQ=255) aactgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcactg < 1:1824051‑M1/22‑1 (MQ=255) actgctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTc < 1:2125711‑M1/4‑1 (MQ=255) gACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTAtt > 1:3649350/1‑50 (MQ=255) gACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTAtt > 1:4341747/1‑50 (MQ=255) gACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTAtt > 1:1942032/1‑50 (MQ=255) gACGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTAtt > 1:2613642/1‑50 (MQ=255) aCGCTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGAcactgcactg < 1:174882/68‑1 (MQ=255) gctggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAt < 1:3844315‑M1/25‑1 (MQ=255) tggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGa > 1:1994275‑M1/44‑55 (MQ=255) cTATCCGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAt > 1:2800282/1‑68 (MQ=255) ggctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt < 1:3520655‑M1/26‑1 (MQ=255) gctttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGAcactgcactg > 1:3012288‑M1/42‑63 (MQ=255) tttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGa < 1:1748668‑M1/24‑1 (MQ=255) tttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGa < 1:1628477‑M1/24‑1 (MQ=255) ccGCTGCCGGGATTTATTCATATACTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGAt > 1:3394634/1‑70 (MQ=255) ttgtacaaaccaggagtcgtttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATg < 1:2937853‑M1/32‑1 (MQ=255) 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tttcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatga > 1:1815812‑M1/20‑71 (MQ=255) ataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaaa < 1:1790571/53‑1 (MQ=255) ataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat > 1:3510537/1‑71 (MQ=255) ataCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgat > 1:1225168/1‑71 (MQ=255) tcacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGt < 1:4751348‑M1/46‑1 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg < 1:3161441/71‑1 (MQ=255) taCTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg < 1:1620630/71‑1 (MQ=255) cacccgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatgatg > 1:3410516‑M1/17‑70 (MQ=255) cTCCTGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGaa > 1:3980903/1‑71 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATg < 1:2632452‑M1/32‑1 (MQ=255) cgcgaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActc < 1:3823331‑M1/59‑1 (MQ=255) tGGCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACg < 1:3086599/49‑1 (MQ=255) ggCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:4637495/1‑71 (MQ=255) gaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCAGTGGAtt > 1:611345‑M1/10‑35 (MQ=255) gaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt > 1:3965990‑M1/10‑35 (MQ=255) gaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt > 1:724732‑M1/10‑35 (MQ=255) gaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt > 1:672365‑M1/10‑35 (MQ=255) gaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt > 1:2180552‑M1/10‑35 (MQ=255) gaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt > 1:2575167‑M1/10‑35 (MQ=255) gaaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGAtt > 1:3744707‑M1/10‑35 (MQ=255) gCGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAActct < 1:4555348/69‑1 (MQ=255) cGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTa > 1:947838/1‑69 (MQ=255) cGACTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACa < 1:4217485/71‑1 (MQ=255) aaaaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgat > 1:1067068‑M1/9‑58 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGaa < 1:3898112‑M1/34‑1 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTtgatga < 1:819634‑M1/52‑1 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc > 1:3200479‑M1/7‑71 (MQ=255) aaaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc > 1:3782446‑M1/7‑71 (MQ=255) cTTGTATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCt < 1:122710/71‑1 (MQ=255) aaataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGc > 1:1123800‑M1/6‑70 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:1024303‑M1/5‑71 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:375448‑M1/5‑71 (MQ=255) aataATTCAGCTAAGACACTGCACTGGATTAAGATGAAAACGATTGAAGTTGATGATGAACTCTACAGCta > 1:2404472‑M1/5‑71 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |