| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | Exported | = 1008499 | 75 (1.080) | coding (1252/1383 nt) | ydgI | predicted arginine/ornithine antiporter transporter | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
TGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGATAATGTAC > Exported/1008417‑1008553 | tgtCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCgttg < 1:4208170/71‑1 (MQ=255)tgtCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCgttg < 1:3699329/71‑1 (MQ=255) gtCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCgtt > 1:4070379/1‑69 (MQ=255) ggTGCCTGCATTTATGTCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTc < 1:1197952/70‑1 (MQ=255) ggTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTc < 1:3343422/70‑1 (MQ=255) ggTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTc < 1:3305008/70‑1 (MQ=255) ggTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTc < 1:660760/70‑1 (MQ=255) ggTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTc < 1:242103/70‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |