| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 2578583 = | 99 (1.340) | 7 (0.100) | 3/94 | NT | 7.4% | coding (82/1398 nt) | yhjA | predicted cytochrome C peroxidase |
| ? | Exported | 2578605 = | 82 (1.190) | coding (104/1398 nt) | yhjA | predicted cytochrome C peroxidase | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTTCTCCGCGAAAAAGG > Exported/2578535‑2578674 | ctggctggCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTaa < 1:49630/71‑1 (MQ=255)ctggctggCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTaa < 1:1418540/71‑1 (MQ=255) accttattattttcactgacagcagatgcctgaacatcggcctgttTACCACGATAATAAACGCAGTAAAc > 1:4468896‑M1/47‑71 (MQ=255) gcGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGcc > 1:2164999/1‑71 (MQ=255) gcGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGcc > 1:3703922/1‑71 (MQ=255) gcGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGcc > 1:3344357/1‑71 (MQ=255) gcGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGc > 1:4274761/1‑70 (MQ=255) gcgATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGt > 1:2311941/1‑71 (MQ=255) gcgATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGt > 1:2161935/1‑71 (MQ=255) gcgATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGt > 1:1580491/1‑71 (MQ=255) cgATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGtt < 1:1024799/71‑1 (MQ=255) gATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGtt > 1:2916068/1‑70 (MQ=255) gATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGtt > 1:3117402/1‑70 (MQ=255) aTTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCa < 1:4288308/71‑1 (MQ=255) tttGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGtt > 1:3458546/1‑68 (MQ=255) tttGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGtt > 1:659509/1‑68 (MQ=255) tttGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAg > 1:3510479/1‑71 (MQ=255) tGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAgg < 1:629134/70‑1 (MQ=255) cTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCa < 1:3845660/70‑1 (MQ=255) tAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTaaa > 1:861196/1‑47 (MQ=255) tAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAAc > 1:2247153/1‑48 (MQ=255) tAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAAc > 1:838052/1‑48 (MQ=255) tAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAg > 1:3033430/1‑62 (MQ=255) tAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAg > 1:1400814/1‑62 (MQ=255) tAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAg > 1:2177059/1‑62 (MQ=255) tAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATctgct > 1:81945/1‑71 (MQ=255) ggTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTc < 1:2873608/71‑1 (MQ=255) ggTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTc < 1:1758317/71‑1 (MQ=255) tATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGt > 1:2446134/1‑71 (MQ=255) 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ggTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACa > 1:3387014/1‑38 (MQ=255) ggTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGAt > 1:2047493/1‑45 (MQ=255) ggTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGAt > 1:354893/1‑45 (MQ=255) ggTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGAt > 1:921285/1‑45 (MQ=255) ggTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATctgct > 1:664003/1‑60 (MQ=255) ggTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATctgct > 1:4726683/1‑60 (MQ=255) catcggcctgttTACCACGATAATAAACGCAGTAAAc > 1:3578354‑M1/13‑37 (MQ=255) gTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAAGAGGCCGATGTTAAGGCATCTGCTGTCAGTGaa < 1:1400099/68‑1 (MQ=255) gTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGAt > 1:4206449/1‑44 (MQ=255) gTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGaaaa < 1:983231/70‑1 (MQ=255) gTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGa < 1:206022/67‑1 (MQ=255) gTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGa < 1:181953/67‑1 (MQ=255) tATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTc < 1:3316923/60‑1 (MQ=255) aTGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCa > 1:2595347/1‑46 (MQ=255) aTGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAaataa < 1:4303769/70‑1 (MQ=255) tgtgtgGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAaataat < 1:529743/70‑1 (MQ=255) tgtgtgGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAataata < 1:1873544/71‑1 (MQ=255) tgGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGt > 1:3737863/1‑71 (MQ=255) gtttactgcgtttattatcgtggtaAACAGGCCGATg > 1:3578354‑M2/26‑37 (MQ=255) gtttactgcgtttattatcgtggtaAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGt > 1:4468896‑M2/26‑71 (MQ=255) ggTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCAt > 1:2344073/1‑45 (MQ=255) gTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAg < 1:1649234/40‑1 (MQ=255) gTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAg < 1:3498653/40‑1 (MQ=255) gTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAg < 1:3775785/40‑1 (MQ=255) gTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGt < 1:2739674/51‑1 (MQ=255) gTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGtt < 1:3043759/70‑1 (MQ=255) actgcgtttattatcgtggtaAACAGGCCGATGTTCAGGCATct < 1:313463‑M2/23‑1 (MQ=255) ACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAAtaataa < 1:954768‑M1/64‑1 (MQ=255) CCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAg > 1:2674606‑M1/1‑71 (MQ=255) tgcgtttattatcgtggtaAACAGGCCGATGTTCAGGCATctgc > 1:2270571‑M2/20‑44 (MQ=255) tgcgtttattatcgtggtaAACAGGCCGATGTTCAGGCATctgc > 1:3083996‑M2/20‑44 (MQ=255) tgcgtttattatcgtggtaAACAGGCCGATGTTCAGGCATctgc > 1:2493949‑M2/20‑44 (MQ=255) cGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCa > 1:3052429/1‑47 (MQ=255) cGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCt > 1:23684/1‑71 (MQ=255) cGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCt > 1:1282901/1‑71 (MQ=255) cGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCt < 1:3715350/71‑1 (MQ=255) cGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCt < 1:945466/71‑1 (MQ=255) cGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCt > 1:3178399/1‑71 (MQ=255) ataataAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCttt < 1:3003724/71‑1 (MQ=255) taaACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTtctc < 1:2839579/70‑1 (MQ=255) aaaCGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGt > 1:3122625/1‑56 (MQ=255) aaaCGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTTCTCcg > 1:4314509/1‑71 (MQ=255) aaCGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTTCTCcg < 1:807768/70‑1 (MQ=255) aaCGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTACTCcgc > 1:2682624/1‑71 (MQ=255) cAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTTCTCCGCGaaa < 1:1473253/71‑1 (MQ=255) aGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTTCTCCGCGaaaa < 1:3796685/71‑1 (MQ=255) gtaAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTTCTCCGCGaaaaa < 1:4029133‑M2/68‑1 (MQ=255) taAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAaataat < 1:83577‑M2/41‑1 (MQ=255) taAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTTCTCCGCGaa < 1:876039‑M2/65‑1 (MQ=255) aAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTtctc > 1:2449118‑M2/2‑60 (MQ=255) aAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTtctc > 1:2378653‑M2/2‑60 (MQ=255) aAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTtctc > 1:1149441‑M2/2‑60 (MQ=255) aAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTTCTCCGCGAAAAAg < 1:1780310‑M2/69‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAg > 1:2863153/1‑44 (MQ=255) aaCAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAg > 1:1191674/1‑44 (MQ=255) aaCAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAg > 1:1108666/1‑44 (MQ=255) aaCAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAg > 1:3423831/1‑51 (MQ=255) aaCAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAg > 1:3674439/1‑51 (MQ=255) aaCAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTTCTCCGCGAAAAAgg > 1:3811361/1‑70 (MQ=255) | CTGGCTGGCGTCGCGATTTGCTATTTAGGGTTATCTGGTTATGTGTGGTACCACGATAATAAACGCAGTAAACAGGCCGATGTTCAGGCATCTGCTGTCAGTGAAAATAATAAGGTTTTAGGCTTTCTCCGCGAAAAAGG > Exported/2578535‑2578674 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |