| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 205174 = | NA (NA) | 9 (0.170) | 4/92 | NT | NA | noncoding (591/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
| ? | Exported | 205200 = | NA (NA) | noncoding (617/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA | |||||
CCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Exported/205247‑205174‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaataGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGAT > Exported/205200‑205269 CCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAG < 1:1240486/70‑1CCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAG < 1:2320529/70‑1CCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAG < 1:3008512/70‑1CCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAG < 1:1730591/70‑1CCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCACTATTCGGTTAACCTTGCTACAG < 1:3723943/70‑1 TGCAACTTAACGCCCAGTTTAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAG < 1:2079862/67‑1 TGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATA > 1:1783251/1‑71 TGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATA > 1:1934603/1‑71 TGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATA > 1:3482920/1‑71 TGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAA > 1:919329/1‑69 TGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAA > 1:2761093/1‑69 GCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATA > 1:2431355/1‑70 GCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATA > 1:1588203/1‑70 GCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATA > 1:2194125/1‑70 GCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATA > 1:3290949/1‑70 GCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATA > 1:197809/1‑70 CAACTTATCGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATA < 1:1512969/69‑1 CAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAA > 1:604328/1‑67 CAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAA > 1:1954097/1‑67 CGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGA > 1:3161836/1‑58 CCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATA > 1:1679787/1‑59 CCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATA > 1:1423239/1‑59 GTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAA < 1:951262/53‑1 GTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAA < 1:462346/53‑1 GTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAG < 1:2085757/51‑1 GTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAG < 1:3248295/51‑1 TTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGA < 1:535253/51‑1 TAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAG > 1:826041/1‑49 CTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAA > 1:3141335/1‑46 CTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAA > 1:2106433/1‑46 CTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAA > 1:3015809/1‑46 CTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAA > 1:899831/1‑46 GTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGA < 1:3699892/41‑1 CCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAAT < 1:1293531/38‑1 CCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAAT < 1:1290427/38‑1 CCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTT > 1:2357167/1‑71 ATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATAGGGGAGCCTAAGGGAAACCGAGTCTTAACTG < 1:486077/56‑1 ATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTG < 1:1887449/56‑1 ATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTG < 1:3142502/56‑1 TTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCA < 1:2410486/69‑1 TTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCA < 1:943997/69‑1 TTCGGTTAACCTTGCTACAGAATATGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCA < 1:3437820/69‑1 TTCGGTTAACCTTGCTACAGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACC > 1:2820294/1‑43 TTCGGTTAACCTTGCTACAGAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACC > 1:487582/1‑43 GAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGG < 1:996658/71‑1 GAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGG < 1:2784818/71‑1 GAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGG < 1:1836502/71‑1 GAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGG < 1:1872111/71‑1 GAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGG < 1:1868115/71‑1 GAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGC > 1:2913450/1‑49 GAATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGATAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGG > 1:283015/1‑71 AATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGT > 1:3066559/1‑71 AATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGT > 1:1844702/1‑71 AATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCAGAAACCCGGT > 1:979437/1‑71 ATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGA < 1:1411997/62‑1 ATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGT < 1:933472/52‑1 ATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGT < 1:2764648/44‑1 ATAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGT < 1:527745/44‑1 TAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGA > 1:1800393/1‑71 TAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGA > 1:277712/1‑71 AGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGAT > 1:633307/1‑71 AGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTG < 1:705619/69‑1 AGGGGAGACGAAGGGAAACCGAGACTTAACTGGGCGTTAAGTTGCA > 1:1786552/1‑46 CCCTGCAACTTAACGCCCAGTTAAGACTCGGTTTCCCTTCGGCTCCCCTATTCGGTTAACCTTGCTACAGAATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Exported/205247‑205174‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaataGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGAT > Exported/205200‑205269 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |