| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 206717 = | NA (NA) | 4 (0.070) | 4/96 | NT | NA | noncoding (2134/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
| ? | Exported | 206765 = | NA (NA) | noncoding (2182/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA | |||||
GTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACACTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < Exported/206789‑206717‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cttTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGG > Exported/206765‑206834 GTCCACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACAC < 1:3338105/71‑1GTCATCGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACAC < 1:1519192/71‑1GTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAATGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACAC > 1:2361385/1‑71GTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACAC < 1:82952/71‑1GTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACAC > 1:483696/1‑71GTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACAC < 1:1837145/71‑1GTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGGTGGTATTTCAAGGTCGGCTCCATGCAGACTGGCGTCCACAC > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |