New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | Exported | 1736409 = | 35 (0.590) | 3 (0.050) | 3/96 | NT | 8.6% | coding (341/681 nt) | rnc | RNase III |
? | Exported | 1736433 = | 31 (0.560) | coding (317/681 nt) | rnc | RNase III |
AGGATTAATTTCTCGACGGTTTGAATATCACTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCACCTGGCCCTAAACGTAAG > Exported/1736340‑1736471 | aGGATTAATTTCTCGACGGTTTGAATATCACTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTc < 1:2770331/71‑1 (MQ=255) tAATTTCTCGACGGTTTGAATATCACTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc > 1:1910205/1‑69 (MQ=255) tAATTTCTCGACGGTTTGAATATCACTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGc > 1:1973222/1‑69 (MQ=255) tttCTCGACGGTTTGAATATCACTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGaa > 1:1664456/1‑71 (MQ=255) ctcGACGGTTTGAATATCACTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAAtt < 1:1284327/70‑1 (MQ=255) ctcGACGGTTTGAATATCACTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAAtt < 1:1286435/70‑1 (MQ=255) tGAATATCACTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCacgac < 1:831171/70‑1 (MQ=255) tGAATATCACTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCacgac < 1:243197/70‑1 (MQ=255) tGAATATCACTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCacgac < 1:2856322/70‑1 (MQ=255) ggcgagtgcttacgtttagggccaggtgaacttaaaagcggtggattTCGGCGAGAATTGACTCAcgacga > 1:1608419‑M1/48‑71 (MQ=255) gAATATCACTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCacgacg > 1:1552157/1‑70 (MQ=255) atCACTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATc > 1:808584/1‑71 (MQ=255) tCACTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATcc < 1:1810062/71‑1 (MQ=255) cTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCAcc > 1:3485548/1‑71 (MQ=255) tCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCt < 1:3026344/71‑1 (MQ=255) cgtttagggccaggtgaacttaaaagcggtggattTCGGCGAGAATTGACt > 1:1031931‑M1/36‑51 (MQ=255) gAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCgag < 1:3686574/42‑1 (MQ=255) tttagggccaggtgaacttaaaagcggtggattTCGGCGAGAATTGACTCa < 1:339068‑M1/18‑1 (MQ=255) aGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCttt > 1:2670287/1‑70 (MQ=255) aTACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGt > 1:580872/1‑71 (MQ=255) tACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCa > 1:1055085/1‑46 (MQ=255) tACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCAc > 1:2559445/1‑59 (MQ=255) tACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCAc > 1:3673265/1‑59 (MQ=255) aCGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGa > 1:138782/1‑41 (MQ=255) aCGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGa > 1:2083998/1‑41 (MQ=255) cGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCa < 1:2705487/71‑1 (MQ=255) gCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACAGCTTTTAAGTTCAc < 1:284383/71‑1 (MQ=255) caccaATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCACCt < 1:655334/71‑1 (MQ=255) caccaATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCACCt > 1:3365374/1‑71 (MQ=255) accaATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCACCTg < 1:2194738/71‑1 (MQ=255) caATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCACCTgg < 1:3636044/70‑1 (MQ=255) caATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCACCTGGc > 1:1317243/1‑71 (MQ=255) caATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCACCTGGc > 1:1823244/1‑71 (MQ=255) aTTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCACCTGGccc > 1:263460/1‑71 (MQ=255) aaTGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATcc > 1:1471977/1‑44 (MQ=255) cTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCACCTGGcc > 1:689695/1‑63 (MQ=255) cTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCACCTGGCCCTAAACGt < 1:3167909/71‑1 (MQ=255) cTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCAAGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCACCTGGcc > 1:2954186/1‑63 (MQ=255) cGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGt > 1:2200197/1‑50 (MQ=255) cGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCACCTGGCCCTAAACGTa < 1:630039/69‑1 (MQ=255) cGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCACCTGGCCCTAAACGTAAg > 1:833385/1‑71 (MQ=255) TCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGt > 1:1894138‑M1/1‑42 (MQ=255) | AGGATTAATTTCTCGACGGTTTGAATATCACTGTCGAGGAATACGCCACCAATTAATGCTTCGACGGTGTCGGCGAGAATTGACTCACGACGAAATCCACCGCTTTTAAGTTCACCTGGCCCTAAACGTAAG > Exported/1736340‑1736471 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |