| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 2114423 = | 86 (1.460) | 4 (0.080) | 3/90 | NT | 5.6% | coding (523/2517 nt) | yraJ | predicted outer membrane protein |
| ? | Exported | 2114447 = | 60 (1.150) | coding (547/2517 nt) | yraJ | predicted outer membrane protein | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
CAGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGTCTCCCCTTCTCGTTGGGACGATGGTATACCAACGCTGTTTACCAACTACTCGTTTACAGGTTCTGATAACCGTTACCGC > Exported/2114354‑2114491 | ctgtcgttggctacgattgccctggcggtaacggttatcagaacctgtaaacgagtagttggtaaacagCg > 1:2060579‑M1/70‑71 (MQ=255)caGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGTCTCCCCTTCTCg > 1:3350557/1‑71 (MQ=255)caGCAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGTCTCCCCTTCTCg > 1:626454/1‑71 (MQ=255) tcgttggctacgattgccctggcggtaacggttatcagaacctgtaaacgagtagttggtaaacagCg > 1:172179‑M1/67‑68 (MQ=255) tcgttggctacgattgccctggcggtaacggttatcagaacctgtaaacgagtagttggtaaacagCGtt > 1:2343176‑M1/67‑70 (MQ=255) tcgttggctacgattgccctggcggtaacggttatcagaacctgtaaacgagtagttggtaaacagCGtt > 1:3642166‑M1/67‑70 (MQ=255) tcgttggctacgattgccctggcggtaacggttatcagaacctgtaaacgagtagttggtaaacagCGtt > 1:2425215‑M1/67‑70 (MQ=255) tcgttggctacgattgccctggcggtaacggttatcagaacctgtaaacgagtagttggtaaacagCGtt > 1:1487531‑M1/67‑70 (MQ=255) tcgttggctacgattgccctggcggtaacggttatcagaacctgtaaacgagtagttggtaaacagCGt > 1:2853607‑M1/67‑69 (MQ=255) tcgttggctacgattgccctggcggtaacggttatcagaacctgtaaacgagtagttggtaaacagCGTTg > 1:605852‑M1/67‑71 (MQ=255) tcgttggctaagattgccctggcggtaacggttatcagaacctgtaaacgagtagttggtaaacagCGTTg > 1:173007‑M1/67‑71 (MQ=255) cAACTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGTCTCCCCTTCTCGTTg > 1:1283896/1‑71 (MQ=255) cgttggctacgattgccctggcggtaacggttatcagaacctgtaaacgagtagttggtaaacagCGTTg > 1:399306‑M1/66‑70 (MQ=255) aaCTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGTCTCCCCTTCTCGTTgg > 1:377541/1‑71 (MQ=255) aaCTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGTCTCCCCTTCTCGTTgg < 1:2841658/71‑1 (MQ=255) cTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGTCTCCCCTTCTCGTTGGGa < 1:669180/71‑1 (MQ=255) cTTAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGTCTCCCCTTCTCGTTGGGa < 1:895257/71‑1 (MQ=255) ttAATTTGAGCATTCCCCAAATTGCACTGTACCGTGATGCAAGAGGTTACGTCTCCCCTTCTCGt < 1:331448/65‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |