| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 809715 = | 82 (1.390) | 4 (0.070) | 3/94 | NT | 5.5% | coding (312/1092 nt) | ychF | predicted GTP‑binding protein |
| ? | Exported | 809751 = | 62 (1.140) | coding (276/1092 nt) | ychF | predicted GTP‑binding protein | |||||
AAACGTGAATGATGTTGTCATTTTCAAAGCAGCGAACAACGTGACCGATCGCTTCGGTTTCACGGATGTTGGTCAGGAACTGGTTACCCAGACCTTCGCCTTTCGATGCGCCTTTTACCAGACCGGCGATATCGACAAATT > Exported/809681‑809821 | aaaCGTGAATGATGTTGTCATTTTCAAAGCAGCGAACAACGTGACCGATCGCTTCGGTTTCACGGATGTTg < 1:3046843/71‑1 (MQ=255) aaCGTGAATGATTTTGTCATTTTCAAAGCAGCGAACAACGTGACCGATCGCTTCGGTTTCACGGATGTTgg < 1:1944961/71‑1 (MQ=255) aaCGTGAATGATGTTGTCATTTTCAAAGCAGCGAACAACGTGACCGATCGCTTCGGTTTCACGGATGTTgg > 1:2302622/1‑71 (MQ=255) aaCGTGAATGATGTTGTCATTTTCAAAGCAGCGAACAACGTGACCGATCGCTTCGGTTTCACGGATGTTgg > 1:1215019/1‑71 (MQ=255) aaCGTGAATGATGTTGTCATTTTCAAAGCAGCGAACAACGTGACCGATCGCTTCGGTTTCACGGATGTTgg < 1:413364/71‑1 (MQ=255) aCGTGAATGATGTTGTCATTTTCAAAGCAGCGAACAACGTGACCGATCGCTTCGGTTTCACGGATGTTGGt > 1:3001040/1‑71 (MQ=255) aCGTGAATGATGTTGTCATTTTCAAAGCAGCGAACAACGTGACCGATCGCTTCGGTTTCACGGATGTTGGt > 1:329912/1‑71 (MQ=255) gAATGATGTTGTCATTTTCAAAGCAGCGAACAACGTGACCGATCGCTTCGGTTTCACGGATGTTGGTCAg > 1:1113160/1‑70 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |