| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 1400840 = | 60 (1.020) | 4 (0.080) | 3/90 | NT | 6.7% | coding (555/714 nt) | yeiU | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase |
| ? | Exported | 1400874 = | 58 (1.110) | coding (589/714 nt) | yeiU | undecaprenyl pyrophosphate phosphatase | |||||
CCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTA > Exported/1400804‑1400942 | gggcaaaccgatcaatatcacggtcatcgaaccgacAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTg > 1:727321‑M1/37‑71 (MQ=255) cTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGt < 1:364702/71‑1 (MQ=255) ttattTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGt < 1:2878864/71‑1 (MQ=255) ttattTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGAGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGt < 1:2565774/71‑1 (MQ=255) attTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTc > 1:1115246/1‑71 (MQ=255) tttttGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTc > 1:1212021/1‑70 (MQ=255) tttttGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTc < 1:3607362/70‑1 (MQ=255) tttttGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTc > 1:1496806/1‑70 (MQ=255) tttttGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCg < 1:1167572/71‑1 (MQ=255) ttGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGAt < 1:2079558/70‑1 (MQ=255) ttGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGAt < 1:3674839/70‑1 (MQ=255) gtgGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGa < 1:1141798/70‑1 (MQ=255) tttGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGAcc > 1:2356355/1‑66 (MQ=255) tttGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGAcc > 1:1887446/1‑66 (MQ=255) tttGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGa > 1:2335461/1‑70 (MQ=255) ttGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCgg < 1:3582419/55‑1 (MQ=255) ttGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCgg < 1:2199620/55‑1 (MQ=255) ttGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCgg < 1:1931449/55‑1 (MQ=255) ttGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCgg < 1:1983427/55‑1 (MQ=255) 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ATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTg > 1:2790057‑M1/1‑71 (MQ=255) ATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTg < 1:2740909‑M1/71‑1 (MQ=255) ATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTg < 1:3044607‑M1/71‑1 (MQ=255) ATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTg < 1:3419467‑M1/71‑1 (MQ=255) ATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGgt < 1:1060572‑M1/71‑1 (MQ=255) TTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGt > 1:3359106‑M1/1‑35 (MQ=255) cgcACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGc < 1:234015/71‑1 (MQ=255) gcACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCt < 1:1766336/71‑1 (MQ=255) gcACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCt < 1:19003/71‑1 (MQ=255) gcACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCt < 1:669262/71‑1 (MQ=255) 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CCTTATTATTTTTGTGGTTTTTGCATTTCCCAGAGTAATGATTGGCGCACACTGGTTTACTGACATCATTGTCGGTTCGATGACCGTGATATTGATCGGTTTGCCCTGGGTGTTGCTGACGCCATTAAGTGATCGATTA > Exported/1400804‑1400942 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |