| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | 1616198 = | 51 (0.860) | 6 (0.120) | 3/88 | NT | 11.9% | coding (408/837 nt) | eutJ | predicted chaperonin, ethanolamine utilization protein |
| ? | Exported | 1616221 = | 45 (0.880) | coding (385/837 nt) | eutJ | predicted chaperonin, ethanolamine utilization protein | |||||
CAATGCCGGTAGTGCCGCCGCCGATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCACGTTGATGGAAATACGCGGG > Exported/1616152‑1616291 | cAATGCCGGTAGTGCCGCCGCCGATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCg > 1:1794081/1‑71 (MQ=255) aTGCCGGTAGTGCCGCCGCCGATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGt > 1:246034/1‑71 (MQ=255) cGGTAGTGCCGCCGCCGATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTgg > 1:3231672/1‑70 (MQ=255) cGGTAGTGCCGCCGCCGATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGc > 1:1675290/1‑71 (MQ=255) cGGTAGTGCCGCCGCCGATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGc > 1:1061875/1‑71 (MQ=255) gTAGTGCCGCCGCCGATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTc < 1:1064308/71‑1 (MQ=255) gTAGTGCCGCCGCCGATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTc < 1:489370/71‑1 (MQ=255) gTAGTGCCGCCGCCGATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTc < 1:354724/71‑1 (MQ=255) tAGTGCCGCCGCCGATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCa < 1:1162273/71‑1 (MQ=255) ccgccgccgATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAg > 1:3026561/1‑71 (MQ=255) ccgccgccgATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAg > 1:1321317/1‑71 (MQ=255) gccgccgATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGca < 1:2829848/71‑1 (MQ=255) gccgccgATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGca < 1:671461/71‑1 (MQ=255) ccgccgATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGcac < 1:3339157/71‑1 (MQ=255) gccgATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGcaca > 1:2112291/1‑70 (MQ=255) gccgATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACAt < 1:2094160/71‑1 (MQ=255) gccgATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACAt < 1:2357645/71‑1 (MQ=255) ccgATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATc > 1:2219979/1‑62 (MQ=255) ccgATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATc > 1:2414382/1‑62 (MQ=255) ccgATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAg < 1:205880/65‑1 (MQ=255) ccgATATCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATg > 1:320601/1‑71 (MQ=255) atatCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCt < 1:1708876/71‑1 (MQ=255) tatCCACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCt > 1:1568180/1‑70 (MQ=255) cACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACt < 1:2261927/70‑1 (MQ=255) cACTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACt < 1:2638935/70‑1 (MQ=255) aCTACACCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTc > 1:2546109/1‑71 (MQ=255) cTACACAGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACtt > 1:2470472/1‑69 (MQ=255) acCGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTc < 1:1888058/71‑1 (MQ=255) ccGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGc > 1:3349756/1‑51 (MQ=255) ccGGCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATACAGc > 1:2149749/1‑51 (MQ=255) ggCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCa < 1:1275839/47‑1 (MQ=255) ggCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCa < 1:3436161/47‑1 (MQ=255) ggCGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCa < 1:348012/47‑1 (MQ=255) cGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTTATCCAGca > 1:2093354/1‑48 (MQ=255) cGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGca > 1:8177/1‑48 (MQ=255) cGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCa < 1:1199551/71‑1 (MQ=255) cGTTGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCa < 1:2849867/71‑1 (MQ=255) ttGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGc < 1:1253401/45‑1 (MQ=255) ttGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGc < 1:1155586/45‑1 (MQ=255) ttGTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGc < 1:1119501/45‑1 (MQ=255) gTCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGcac > 1:994403/1‑45 (MQ=255) tCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTc > 1:2073056/1‑71 (MQ=255) tCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTc > 1:1244530/1‑71 (MQ=255) tCCAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTc > 1:2767488/1‑71 (MQ=255) CAGTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTc < 1:890210‑M1/69‑1 (MQ=255) agttgcggatctgctgcaactgCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACtt < 1:545211‑M2/30‑1 (MQ=255) agttgcggatctgctgcaactgCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAg > 1:2591948‑M2/23‑71 (MQ=255) GTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACt > 1:1590285‑M1/1‑50 (MQ=255) GTTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACt > 1:1594214‑M1/1‑50 (MQ=255) ttgcggatctgctgcaactgCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTcc > 1:3122775‑M2/21‑52 (MQ=255) ttgcggatctgctgcaactgCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTcc > 1:613515‑M2/21‑52 (MQ=255) ttgcggatctgctgcaactgCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTcc > 1:1168676‑M2/21‑52 (MQ=255) ttgcggatctgctgcaactgCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTcc > 1:2539798‑M2/21‑52 (MQ=255) TTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCa > 1:642642‑M1/1‑71 (MQ=255) TTGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCa < 1:1124093‑M1/71‑1 (MQ=255) TGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTc < 1:2625989‑M1/50‑1 (MQ=255) TGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTc < 1:341172‑M1/50‑1 (MQ=255) TGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTc < 1:335129‑M1/50‑1 (MQ=255) TGCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAgattac < 1:3068161‑M1/66‑3 (MQ=255) GCAGCAGATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCAc > 1:1278442‑M1/1‑70 (MQ=255) cagATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCACGTTGa < 1:1361770/71‑1 (MQ=255) agATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCACGTTGAt > 1:2802499/1‑71 (MQ=255) agATCCGCAACTGCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCACGTTGAt > 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1:2396568‑M2/4‑68 (MQ=255) ctgCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCACGTTGATGGAAATa > 1:2202072‑M2/4‑68 (MQ=255) gCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCa > 1:1257203‑M2/2‑52 (MQ=255) gCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCACGTTGGTGGAAATACGCgg > 1:1050242‑M2/2‑71 (MQ=255) gCGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCACGTTGATGGAAATACGCgg > 1:3320976‑M2/2‑71 (MQ=255) cGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCACGTTGATGGAAATAcgcg < 1:505281/69‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCACGTTGATGGAAATAcgcg < 1:2365844/69‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCACGTTGATGGAAATAcgcg < 1:313658/69‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCACGTTGATGGAAATAcgcg < 1:2602262/69‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCACGTTGATGGAAATAcgcg < 1:1045088/69‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTCATCCAGCACATGGCTCACTTCCAGTCCGGCAGATTCCAGCACGTTGATGGAAATACGCggg < 1:2788081/71‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |