| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
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| ? | Exported | 2716451 = | 78 (1.430) | coding (378/573 nt) | ppiA | peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase A | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GCCTGCGCAACACGCGTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCAACGTTGCCGATAACGCCTTCCTTGACCATGGTCAGCGTGATTTCGGTTACGCGGTATTT > Exported/2716384‑2716520 | cTGCGCAACACGCGTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCtt > 1:3462691/1‑71 (MQ=255) tGCGCAACACGCGTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCt < 1:650184/69‑1 (MQ=255) cgcAACACGCGTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTAt > 1:3029210/1‑71 (MQ=255) cgcAACACGCGTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTAt > 1:518535/1‑71 (MQ=255) aaCACGCGTGGAACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCaa > 1:289056/1‑71 (MQ=255) cacGCGTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCAACg > 1:2483714/1‑71 (MQ=255) acGCGTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCAACGt > 1:3102780/1‑71 (MQ=255) acGCGTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCAACGt > 1:1093173/1‑71 (MQ=255) acGCGTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCAACGt > 1:3310692/1‑71 (MQ=255) acGCGTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCAACGt < 1:3335959/71‑1 (MQ=255) acGCGTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCAACGt > 1:2221349/1‑71 (MQ=255) acGCGTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCAACGt > 1:2046868/1‑71 (MQ=255) cgcgTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCAACGtt < 1:1020795/71‑1 (MQ=255) cgcgTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCAACGtt < 1:2458874/71‑1 (MQ=255) cgcgTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCAACGtt < 1:810640/71‑1 (MQ=255) gcgTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCAACGTTg > 1:2393262/1‑71 (MQ=255) gcgTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCAACGTTg < 1:3254979/71‑1 (MQ=255) gcgTGGCACCATCGCGATGGCACGTACCGCTGACAAAGACAGCGCCACCAGCCAGTTCTTTATCAACGTTg < 1:2758910/71‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |