| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | Exported | 2,460,535 | C→A | 11.0% | intergenic (+153/‑226) | mioC → / → gidA | FMN‑binding protein MioC/glucose‑inhibited cell‑division protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | Exported | 2,460,535 | 0 | C | A | 11.0% | 257.1 / 11.2 | 81 | intergenic (+153/‑226) | mioC/gidA | FMN‑binding protein MioC/glucose‑inhibited cell‑division protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (24/48); new base A (3/6); total (27/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.26e-01 | |||||||||||
CAGTTTTTGAGTTGTGTATAACCCCTCATTCTGATCCCAGCTTATACGGTCCAGGATCACCGATCATTCACAGTTAATGATCCTTTCCAGGTTGTTGATCTTAAAAGCCGGATCCTTGTTATCCACAGGGCAGTGCGA > Exported/2460467‑2460604 | cAGTTTTTGAGTTGTGTATAACCCCTCATTCTGATCCCAGCTTATACGGTCCAGGATCACCGATCATTca < 1:285029/70‑1 (MQ=255)cAGTTTTTGAGTTGTGTATAACCCCTCATTCTGATCCCAGCTTATACGGTCCAGGATCACCGATCATTca > 1:300704/1‑70 (MQ=255)cAGTTTTTGAGTTGTGTATAACCCCTCATTCTGATCCCAGCTTATACGGTCCAGGATCACCGATCATTca > 1:1267856/1‑70 (MQ=255)cAGTTTTTGAGTTGTGTATAACCCCTCATTCTGATCCCAGCTTATACGGTCCAGGATCACCGATCATTca > 1:3303920/1‑70 (MQ=255)cAGTTTTTGAGTTGTGTATAACCCCTCATTCTGATCCCAGCTTATACGGTCCAGGATCACCGATCATTca > 1:1995650/1‑70 (MQ=255) aGTTTTTGAGTTGTGTATAACCCCTCATTCTGATCCCAGCTTATACGGTCCAGGATCACCGATCATTcac < 1:3078738/70‑1 (MQ=255) aGTTTTTGAGTTGTGTATAACCCCTCATTCTGATCCCAGCTTATACGGTCCAGGATCACCGATCATTca > 1:845796/1‑69 (MQ=255) aGTTTTTGAGTTGTGTATAACCCCTCATTCTGATCCCAGCTTATACGGTCCAGGATCACCGATCATTca > 1:1501705/1‑69 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |