| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 225282 = | NA (NA) | 7 (0.140) | 3/92 | NT | 100% | noncoding (1512/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA |
| ? | AP009048 | 225294 = | 0 (0.000) | noncoding (1524/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA | |||||
ACAATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAcggtt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/225351‑225282‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAG > AP009048/225294‑225368 ACAATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAC > 1:612570/1‑71ACAATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAC < 1:5020685/71‑1ACAATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAC < 1:3015945/71‑1 CAATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAC < 1:2093939/70‑1 ATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT > 1:4885788/1‑71 ATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT < 1:3513395/71‑1 ATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT < 1:279707/71‑1 GTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACG > 1:1143211/1‑63 CAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACG > 1:2718661/1‑53 AAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGT < 1:2614061/54‑1 ACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT < 1:4171881/50‑1 CGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGAAGGTTCCCCTACGG > 1:4141951/1‑47 CTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAC < 1:4313455/43‑1 TTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACGGTT > 1:1543822/1‑43 TTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACG < 1:1389100/40‑1 TTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACG > 1:3878600/1‑40 TAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTACG > 1:319776/1‑38 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGCAGTGCTCACA > 1:4805005/1‑67 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACA > 1:2266345/1‑67 AACCGCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTT > 1:48345/1‑54 AACCGCAGGTTCACCTACGGATGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTG < 1:1748488/61‑1 ACCGCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGCAGTGCTCACACAGAT > 1:2906738/1‑71 GCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAG > 1:4628003/1‑43 GCAGGTTCCCCTACGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAA > 1:4752202/1‑39 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATG < 1:2730957/70‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAAT < 1:3186822/69‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAAT > 1:3383110/1‑69 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAAT < 1:5109122/69‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAA < 1:2760590/66‑1 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGA > 1:4017477/1‑62 CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACAC > 1:3771980/1‑51 CGGTTGGATCACATCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATG < 1:1488593/70‑1 GGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAG > 1:2995864/1‑71 GGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAG > 1:2584032/1‑71 GGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAG < 1:2431649/71‑1 GGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGA < 1:841177/53‑1 GGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCA < 1:1781737/47‑1 GTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGC < 1:2513373/71‑1 GTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTT < 1:1423933/35‑1 TTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCT > 1:985087/1‑43 TGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAG > 1:1194803/1‑71 ACAATCTGTGTGAGCACTGCAAAGTACGCTTCTTTAAGGTAAGGAGGTGATCCAACCGCAGGTTCCCCTAcggtt‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AP009048/225351‑225282‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTACTTTGCAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAG > AP009048/225294‑225368 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |