| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 1933441 = | 53 (0.940) | 3 (0.060) | 3/94 | NT | 5.1% | coding (847/1179 nt) | purT | phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2 |
| ? | AP009048 | 1933468 = | 63 (1.210) | coding (874/1179 nt) | purT | phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2 | |||||
CGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTG > AP009048/1933371‑1933510 | tcccgccaaccggaagtccgaggaaggcacgtacatgcagggcaaactctgagagatcttgagaaattaac > 1:4466996‑M1/71‑71 (MQ=255)cGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTc < 1:789268/71‑1 (MQ=255) cccgccaaccggaagtccgaggaaggcacgtacatgcagggcaaactctgagagatcttgagaaattaaCg < 1:1316728‑M1/2‑1 (MQ=255) ccgccaaccggaagtccgaggaaggcacgtacatgcagggcaaactctgagagatcttgagaaattaaCGt > 1:1467947‑M1/69‑71 (MQ=255) tATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTc > 1:1060144/1‑70 (MQ=255) aTGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTcc < 1:3496910/70‑1 (MQ=255) aTGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCca > 1:3633099/1‑71 (MQ=255) gggTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCcaca > 1:3106699/1‑71 (MQ=255) ggTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACAt < 1:1772683/71‑1 (MQ=255) tgttTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGa > 1:4531625/1‑70 (MQ=255) tttGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATa < 1:4420390/70‑1 (MQ=255) aagtccgaggaaggcacgtacatgcagggcaaactctgagagatcttgagaaattaaCGTc > 1:3276517‑M1/58‑61 (MQ=255) tGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCg > 1:5131524/1‑71 (MQ=255) tGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCg > 1:4676352/1‑71 (MQ=255) gtccgaggaaggcacgtacatgcagggcaaactctgagagatcttgagaaattaaCGTCCACATGATACCg < 1:1708949‑M1/16‑1 (MQ=255) ggTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCg < 1:2789457/70‑1 (MQ=255) gtgtCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCggg < 1:4729170/71‑1 (MQ=255) tgtCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCca < 1:4624653/58‑1 (MQ=255) tCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCcac > 1:3889865/1‑57 (MQ=255) tCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATg > 1:3142184/1‑71 (MQ=255) tCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATg > 1:2945629/1‑71 (MQ=255) aGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGt < 1:2748836/70‑1 (MQ=255) aggcacgtacatgcagggcaaactctgagagatcttgagaaattaaCGTc < 1:2057839‑M1/4‑1 (MQ=255) cTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCca < 1:2775590/51‑1 (MQ=255) tATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCca < 1:4203793/50‑1 (MQ=255) tATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCca < 1:526473/50‑1 (MQ=255) tttGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTcc < 1:3729161/47‑1 (MQ=255) tttGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACg < 1:4030585/69‑1 (MQ=255) tttGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGt > 1:2062751/1‑70 (MQ=255) ttGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGtt > 1:1201147/1‑70 (MQ=255) tGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGt > 1:2605924/1‑63 (MQ=255) tGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGa > 1:2315908/1‑65 (MQ=255) gTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAAt > 1:2566196/1‑71 (MQ=255) tCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAAt < 1:1149789/70‑1 (MQ=255) gtggtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTtct > 1:460159/1‑71 (MQ=255) tggtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAAttt < 1:1526371/68‑1 (MQ=255) tggtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAAttt < 1:3141843/68‑1 (MQ=255) tggtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTtctc < 1:4740357/71‑1 (MQ=255) tggtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTtct > 1:28791/1‑70 (MQ=255) gcagggcaaactctgagagatcttgagaaattaac < 1:281232‑M1/1‑1 (MQ=255) gcagggcaaactctgagagatcttgagaaattaaCGTCCACATGATACCGGGATgg > 1:277680‑M1/35‑56 (MQ=255) gcagggcaaactctgagagatcttgagaaattaaCGTCCACATGATACCGGGATGGTGAc > 1:1723118‑M1/35‑60 (MQ=255) gtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTtctc > 1:5048261/1‑69 (MQ=255) gtgATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCa < 1:2498495/70‑1 (MQ=255) tgatgaGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTtctc < 1:2597560/68‑1 (MQ=255) atgaGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTg < 1:5163091/53‑1 (MQ=255) gaGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGAtct > 1:2381036/1‑71 (MQ=255) aGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGAtctc < 1:3728437/71‑1 (MQ=255) ggTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGAtctct < 1:144370/71‑1 (MQ=255) gTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGAtctct > 1:1213058/1‑70 (MQ=255) tGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCa < 1:2794445/71‑1 (MQ=255) gATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGa > 1:1442217/1‑47 (MQ=255) aTTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCa > 1:4295000/1‑69 (MQ=255) tttCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGt > 1:49781/1‑71 (MQ=255) ttCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGAtctctc > 1:4416945/1‑65 (MQ=255) ttCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGt < 1:166258/70‑1 (MQ=255) ttCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAAATTCTCAAGATCTCTCAGAGt < 1:1580484/70‑1 (MQ=255) tCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGtt < 1:744948/70‑1 (MQ=255) cAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTg > 1:2545638/1‑71 (MQ=255) aGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGc < 1:3323832/71‑1 (MQ=255) tGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGccc > 1:2316398/1‑71 (MQ=255) aGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAg > 1:158074/1‑51 (MQ=255) aGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCt < 1:343011/70‑1 (MQ=255) aGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTg < 1:5135515/71‑1 (MQ=255) gTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGtt > 1:2215080/1‑62 (MQ=255) tcCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCag > 1:18408/1‑55 (MQ=255) ccccTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGccc < 1:3365613/63‑1 (MQ=255) cccTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCa > 1:1724786/1‑66 (MQ=255) cccTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCAt > 1:3676982/1‑67 (MQ=255) cccTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGt < 1:1363784/69‑1 (MQ=255) cccTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTa > 1:435423/1‑70 (MQ=255) cccTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTAc > 1:1475618/1‑71 (MQ=255) ccTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTAc < 1:1656405/70‑1 (MQ=255) ccTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACg > 1:1875449/1‑71 (MQ=255) cTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCaga > 1:1581339/1‑52 (MQ=255) cTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGt > 1:1677858/1‑67 (MQ=255) cTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTa > 1:2841307/1‑68 (MQ=255) tCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTg > 1:4680392/1‑71 (MQ=255) tCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTg > 1:4674338/1‑71 (MQ=255) | CGGTTATGGGTTGTTTGGTGTCGAGCTATTTGTCTGTGGTGATGAGGTGATTTTCAGTGAGGTCTCCCCTCGTCCACATGATACCGGGATGGTGACGTTAATTTCTCAAGATCTCTCAGAGTTTGCCCTGCATGTACGTG > AP009048/1933371‑1933510 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |