| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | = 2365086 | 49 (0.870) | 3 (0.060) | 3/92 | NT | 6.0% | coding (1011/1218 nt) | yfaW | predicted enolase |
| ? | AP009048 | = 2365110 | 50 (0.990) | coding (987/1218 nt) | yfaW | predicted enolase | |||||
CGTTGAACAATCCGGGCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGATTGCGGCAATT > AP009048/2365020‑2365155 | cGTTGAACAATCCGGGCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGt > 1:3313654/1‑71 (MQ=255) gTTGAACAATCCGGGCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGt < 1:5152350/70‑1 (MQ=255) gTTGAACAATCCGGGCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGt < 1:4624558/70‑1 (MQ=255) gTTGAACAATCCGGGCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGt < 1:4082473/70‑1 (MQ=255) gTTGAACAATCCGGGCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTg < 1:1402031/71‑1 (MQ=255) ttGAACAATCCGGGCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTga < 1:4322090/71‑1 (MQ=255) tGAACAATCCGGGCTGGTCATTAGGAATTCGCTGAATTGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGt > 1:2096117/1‑68 (MQ=255) gAACAATCCGGGCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTga > 1:3411230/1‑69 (MQ=255) cAATCCGGGCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGt > 1:4378460/1‑70 (MQ=255) cAATCCGGGCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTa < 1:228471/71‑1 (MQ=255) cAATCCGGGCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTa < 1:4213188/71‑1 (MQ=255) cGGGCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAg < 1:3285180/71‑1 (MQ=255) gggCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTa < 1:1819081/65‑1 (MQ=255) gCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTa < 1:1969393/63‑1 (MQ=255) gCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACg < 1:4519777/71‑1 (MQ=255) gTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAAcc > 1:1392243/1‑71 (MQ=255) atcaGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCAt > 1:1115083/1‑46 (MQ=255) atcaGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCAt > 1:2949557/1‑46 (MQ=255) atcaGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCAt > 1:2858953/1‑46 (MQ=255) atcaGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCAt > 1:721693/1‑46 (MQ=255) atcaGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAAc > 1:962875/1‑59 (MQ=255) atcaGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAAc > 1:1934986/1‑59 (MQ=255) atcaGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAAc > 1:3992195/1‑59 (MQ=255) atcaGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGtg < 1:4373038‑M2/71‑3 (MQ=255) tcaGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTaaa > 1:4523055/1‑57 (MQ=255) caGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGtgcg < 1:2976475‑M2/71‑5 (MQ=255) aGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGtgcgg < 1:1943459‑M2/71‑6 (MQ=255) ggAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGtgcgg < 1:3277743‑M2/70‑6 (MQ=255) aaTTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGcac > 1:3433690/1‑71 (MQ=255) aTTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTg < 1:3239794/43‑1 (MQ=255) aTTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTg < 1:3122131/43‑1 (MQ=255) aTTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTg < 1:5005214/43‑1 (MQ=255) aTTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGtgcg < 1:4252161‑M2/66‑5 (MQ=255) aTTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGtgcg < 1:3853300‑M2/66‑5 (MQ=255) aTTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGcac > 1:1153406/1‑70 (MQ=255) aTTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGcac > 1:359566/1‑70 (MQ=255) tCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGcaccac > 1:2175387/1‑71 (MQ=255) cGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGcaccac > 1:4478640/1‑70 (MQ=255) cGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGcaccac < 1:1594316/70‑1 (MQ=255) gCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTa < 1:4829013/45‑1 (MQ=255) cTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCAcctcca < 1:205573/70‑1 (MQ=255) cTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACACACGAACCGTGCGGCACCACCAg < 1:4073560/71‑1 (MQ=255) tGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCAcggttcgtctgtttactctca > 1:4639309‑M1/1‑32 (MQ=255) tGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGc < 1:4911651/62‑1 (MQ=255) tGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGc < 1:37544/62‑1 (MQ=255) tGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGt > 1:1452157/1‑71 (MQ=255) gAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGtt > 1:1041762/1‑71 (MQ=255) aaTGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTga > 1:1619166/1‑36 (MQ=255) tGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGAc > 1:2781861/1‑46 (MQ=255) tGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATAGTGAGAGTAAACAGAc > 1:731154/1‑46 (MQ=255) aTTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTg > 1:3795306/1‑70 (MQ=255) tGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCATGGAt > 1:2039313/1‑71 (MQ=255) gTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGAttt < 1:3214941/71‑1 (MQ=255) tGAATGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGAt < 1:71859/68‑1 (MQ=255) tGAAGGTGATCACCGCAcggttcgtctgtttactctcacc < 1:3899265‑M1/40‑24 (MQ=255) tGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGAt < 1:3567180/68‑1 (MQ=255) tGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTg < 1:3149888/71‑1 (MQ=255) aaGGTGATCACCGCAcggttcgtctgtttactctcaccat > 1:5135031‑M1/1‑15 (MQ=255) aaGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGc < 1:3994139/71‑1 (MQ=255) aaGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGc < 1:2973218/71‑1 (MQ=255) gTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGAt < 1:3675023/71‑1 (MQ=255) gTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGAATTGGCGAt < 1:1329949/71‑1 (MQ=255) tGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGtgcg < 1:698774‑M2/39‑5 (MQ=255) aTCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGATTGc < 1:444319/71‑1 (MQ=255) tCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGtgcg < 1:2137836‑M2/36‑5 (MQ=255) tCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGtgcg < 1:2622490‑M2/36‑5 (MQ=255) tCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGAttt < 1:4246275/61‑1 (MQ=255) tCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGATTGCg > 1:2082263/1‑71 (MQ=255) cACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGAttt < 1:2192473/60‑1 (MQ=255) cACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGAtt > 1:964129/1‑67 (MQ=255) cACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGATTGCgg > 1:781818/1‑71 (MQ=255) cACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGATTGCgg > 1:4138429/1‑71 (MQ=255) aCCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGATTGCgg < 1:1971257/70‑1 (MQ=255) aCCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGATTGCgg < 1:76167/70‑1 (MQ=255) ccGCAcggttcgtctgtttactctcaccatgcggtgatcaccttcaccaatacgccattcagcgaattcct < 1:1943459‑M1/71‑67 (MQ=255) ccGCAcggttcgtctgtttactctcaccatgcggtgatcaccttcaccaatacgccattcagcgaattcc < 1:3277743‑M1/70‑66 (MQ=255) ccGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGATTGCGGCa < 1:3634139/71‑1 (MQ=255) cGCAcggttcgtctgtttactctcaccatgcggtgatcaccttcaccaatacgccattcagcgaattcctg < 1:2976475‑M1/71‑68 (MQ=255) cGCAcggttcgtctgtttactctcaccatgcggtgatcaccttcaccaatacgccattcagcgaat < 1:4252161‑M1/66‑63 (MQ=255) cGCAcggttcgtctgtttactctcaccatgcggtgatcaccttcaccaatacgccattcagcgaat < 1:3853300‑M1/66‑63 (MQ=255) cGCAcggttcgtctgtttactctcaccatgcggtgatca < 1:698774‑M1/39‑36 (MQ=255) cGCAcggttcgtctgtttactctcaccatgcggtga < 1:2622490‑M1/36‑33 (MQ=255) cGCAcggttcgtctgtttactctcaccatgcggtga < 1:2137836‑M1/36‑33 (MQ=255) cGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGAtt < 1:2759489/64‑1 (MQ=255) cGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGATTGCGGCaa > 1:3235327/1‑71 (MQ=255) cGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGATTGCGGCaa > 1:3484933/1‑71 (MQ=255) gCATGGTGAGAGTAAACAGACGCACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGATTGCGGCaa > 1:1638187/1‑70 (MQ=255) gCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGATTGCGGCAAt > 1:238441/1‑71 (MQ=255) cAcggttcgtctgtttactctcaccatgcggtgatcaccttcaccaatacgccattcagcgaattcctgat < 1:4373038‑M1/71‑70 (MQ=255) aTGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGtgcggtgatcacctt > 1:5135031‑M2/1‑25 (MQ=255) aTGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCAccacca < 1:3265888/38‑1 (MQ=255) | CGTTGAACAATCCGGGCTGGTCATCAGGAATTCGCTGAATGGCGTATTGGTGAAGGTGATCACCGCATGGTGAGAGTAAACAGACGAACCGTGCGGCACCACCAGTTGCCCCCTGGATTTGGCGATTGCGGCAATT > AP009048/2365020‑2365155 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |