| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 4006292 = | 58 (1.030) | 3 (0.060) | 3/94 | NT | 5.9% | coding (336/1239 nt) | yhiL | hypothetical protein |
| ? | AP009048 | 4006323 = | 42 (0.810) | coding (367/1239 nt) | yhiL | hypothetical protein | |||||
AGATATTCAAGAATATAATAGATTCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGTTGAGTGTAAGGGCGGTTATTA > AP009048/4006226‑4006360 | aGATATTCAAGAATATAATAGATTCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCa > 1:520747/1‑67 (MQ=255) gATATTCAAGAATATAATAGATTCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACa < 1:2386022/70‑1 (MQ=255) tatTCAAGAATATAATAGATTCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAAt > 1:2537748/1‑70 (MQ=255) tatTCAAGAATATAATAGATTCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATa < 1:3075254/71‑1 (MQ=255) ttatctccagaggaattaataaaataataaccgcccttacactcaacagtaacggtaatggga < 1:3255879‑M1/1‑1 (MQ=255) gAATATAATAGATTCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCAtgt > 1:1176911/1‑71 (MQ=255) gAATATAATAGATTCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCAtgt > 1:1680998/1‑71 (MQ=255) taataGATTCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTaa < 1:3113504/71‑1 (MQ=255) taGATTCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAAt > 1:4828052/1‑71 (MQ=255) attaataaaataataaccgcccttacactcaacagtaacggtaatgggaga < 1:2348589‑M1/3‑1 (MQ=255) ttaataaaataataaccgcccttacactcaacagtaacggtaatgggAGACAATAACCATGTGTTAAAAtt > 1:3155641‑M1/48‑71 (MQ=255) gATTCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAAtt < 1:2511655/70‑1 (MQ=255) gATTCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTa < 1:4548319/71‑1 (MQ=255) aataaaataataaccgcccttacactcaacagtaacggtaatgggaga < 1:2254675‑M1/3‑1 (MQ=255) aTTCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAAc > 1:2501176/1‑55 (MQ=255) tCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCg > 1:1041651/1‑71 (MQ=255) tCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCg > 1:3823647/1‑71 (MQ=255) gCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGtc < 1:5084152/71‑1 (MQ=255) aaataataaccgcccttacactcaacagtaacggtaatgggaga > 1:2152588‑M1/42‑44 (MQ=255) ccGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTa < 1:1372350/59‑1 (MQ=255) cGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATATCCATGTGTTAAAATTATCg < 1:4080325/67‑1 (MQ=255) cGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTaaa < 1:938044/60‑1 (MQ=255) cGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGtctc > 1:22376/1‑71 (MQ=255) ataataaccgcccttacactcaacagtaacggtaatgggAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATc < 1:4533398‑M1/27‑1 (MQ=255) gACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTa > 1:3776744/1‑57 (MQ=255) gACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTcc < 1:2137310/71‑1 (MQ=255) aaTACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTAt > 1:937841/1‑61 (MQ=255) aaTACTACCGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCAt > 1:3614688/1‑71 (MQ=255) aTACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCAtt < 1:2662075/71‑1 (MQ=255) aTACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCAtt < 1:108859/71‑1 (MQ=255) tactacTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCAt > 1:4555864/1‑46 (MQ=255) tactacTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTa < 1:3612074/71‑1 (MQ=255) tactacTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTa > 1:2898083/1‑71 (MQ=255) tactacTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTa < 1:730652/71‑1 (MQ=255) actactGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTa < 1:2703814/57‑1 (MQ=255) ctactGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTAcc > 1:2484357/1‑71 (MQ=255) ctactGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTAcc < 1:3115433/71‑1 (MQ=255) ctactGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTAcc > 1:2455685/1‑71 (MQ=255) tactGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATa > 1:1358450/1‑38 (MQ=255) ctGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCAtgtg > 1:3179106/1‑44 (MQ=255) gATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAAtt > 1:1013951/1‑50 (MQ=255) aTACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTAc < 1:1873435/70‑1 (MQ=255) aTACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTAc < 1:1251770/70‑1 (MQ=255) aTACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACt > 1:3809695/1‑71 (MQ=255) tACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTg > 1:4562009/1‑71 (MQ=255) tACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTg < 1:1467782/71‑1 (MQ=255) cGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGtt < 1:944275/71‑1 (MQ=255) gTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTaa < 1:5016349/41‑1 (MQ=255) gTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGt > 1:1763430/1‑50 (MQ=255) gTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGTTg < 1:1123092/71‑1 (MQ=255) gTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGTTg < 1:77906/71‑1 (MQ=255) tttATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTaaaa < 1:4936155/42‑1 (MQ=255) ttATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGTTGAg > 1:2544682/1‑71 (MQ=255) tATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTTCTGTTGAgt > 1:2893542/1‑71 (MQ=255) tATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGTTGAgt > 1:2896698/1‑71 (MQ=255) aTCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTccc < 1:818160/51‑1 (MQ=255) aTCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGTTGAgt < 1:4202491/70‑1 (MQ=255) tCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATc > 1:1021271/1‑43 (MQ=255) tCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGTTGAgtg < 1:87076/70‑1 (MQ=255) cagtaacggtaatgggAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGtct < 1:3531018‑M1/31‑1 (MQ=255) tttACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGt > 1:5065294/1‑43 (MQ=255) ttACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTAt > 1:1495997/1‑39 (MQ=255) tACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGTTGAgtgt < 1:4975608/67‑1 (MQ=255) tACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGTTGAGTGTa < 1:3241358/68‑1 (MQ=255) tACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGTTGAGTGTAAg < 1:3411742/70‑1 (MQ=255) aCAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTa < 1:1751145/36‑1 (MQ=255) cAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGTTGAgtgt < 1:2726075/65‑1 (MQ=255) ataCCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGTTGa > 1:3886286/1‑56 (MQ=255) cAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGtt < 1:3172145/50‑1 (MQ=255) cAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGTTGAGTGTAAGGGCGGttatta < 1:2291184/70‑1 (MQ=255) AGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTg > 1:3546503‑M1/1‑47 (MQ=255) | AGATATTCAAGAATATAATAGATTCGCCGACAATACTACTGATACGTTTATCTTTACAATTATACCAGACAATAACCATGTGTTAAAATTATCGTCTCCCATTACCGTTACTGTTGAGTGTAAGGGCGGTTATTA > AP009048/4006226‑4006360 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |