| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP009048 | 71653 = | 80 (1.420) | 4 (0.090) | 4/84 | NT | 6.1% | coding (303/765 nt) | yabI | conserved inner membrane protein |
| ? | AP009048 | 71685 = | 58 (1.250) | coding (335/765 nt) | yabI | conserved inner membrane protein | |||||
CATTTCTGAAGAAAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATGCTGGATCT > AP009048/71616‑71754 | cATTTCTGAAGAAAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCAc > 1:4960764/1‑70 (MQ=255) aTTTCTGAAGAAAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCa < 1:4411612/71‑1 (MQ=255) aTTTCTGAAGAAAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCa > 1:3075777/1‑71 (MQ=255) tttCTGAAGAAAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCAt < 1:4013409/71‑1 (MQ=255) tCTGAAGAAAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCAtt > 1:1599628/1‑70 (MQ=255) cTGAAGAAAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTc < 1:3009291/70‑1 (MQ=255) cTGAAGAAAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTc < 1:4352576/70‑1 (MQ=255) cTGAAGAAAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTc < 1:2904022/70‑1 (MQ=255) cTGAAGAAAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCt > 1:12120/1‑71 (MQ=255) cTGAAGAAAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCt > 1:4832022/1‑71 (MQ=255) tGAAGAAAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTg > 1:2442452/1‑71 (MQ=255) tGAAGAAAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTg > 1:2607293/1‑71 (MQ=255) tcgggccaacaaaacgaccgaccagaatggTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTgg > 1:655399‑M1/31‑71 (MQ=255) gaagaaAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCa < 1:3920137/65‑1 (MQ=255) gaagaaAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTg < 1:2193875/70‑1 (MQ=255) gaaAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTg < 1:4339970/67‑1 (MQ=255) aaaaCAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTggtcggt > 1:3084215/1‑71 (MQ=255) aaaCAAAGCACTACTTGGTAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTggtcggtc > 1:1869600/1‑71 (MQ=255) aaaCAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTggtcggtc < 1:3886230/71‑1 (MQ=255) aaaCAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTggtcggtc > 1:2918445/1‑71 (MQ=255) aCAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTggtc > 1:3726657/1‑65 (MQ=255) aCAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTggtc > 1:3836180/1‑65 (MQ=255) aCAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGt < 1:1778313/71‑1 (MQ=255) aaGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCt > 1:3856489/1‑58 (MQ=255) aaGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCt > 1:89911/1‑58 (MQ=255) aaGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGtttt < 1:2615950/71‑1 (MQ=255) gCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTttgt < 1:4357870/71‑1 (MQ=255) gCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTttgt < 1:1772824/71‑1 (MQ=255) cACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTggt > 1:967226/1‑58 (MQ=255) cACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTggt > 1:4649136/1‑58 (MQ=255) cACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTttgtt < 1:3526910/71‑1 (MQ=255) actactTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTttgttg > 1:2048872/1‑71 (MQ=255) actactTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTttgttg > 1:2651316/1‑71 (MQ=255) actactTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTttgtt < 1:3521039/70‑1 (MQ=255) ctactTGATAAAACTGAACATGTGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTgg < 1:5020755/71‑1 (MQ=255) ctactTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTgg < 1:1787129/71‑1 (MQ=255) ctTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCAtt > 1:2021793/1‑48 (MQ=255) ctTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCAtt > 1:1323492/1‑48 (MQ=255) ctTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTgg < 1:3632980/68‑1 (MQ=255) ctTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGccc < 1:1426423/71‑1 (MQ=255) ttGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGccc > 1:1366075/1‑70 (MQ=255) tGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGccc > 1:2624139/1‑69 (MQ=255) tGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGa > 1:4275523/1‑71 (MQ=255) ccagaatggtgaacatgctgtgttgatgcaacgcatgttcaCCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGa > 1:655399‑M2/42‑71 (MQ=255) gATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCg < 1:4971156/69‑1 (MQ=255) tAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTttgt > 1:405314/1‑60 (MQ=255) tAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTttgt > 1:399238/1‑60 (MQ=255) tAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGccc < 1:3450709/66‑1 (MQ=255) tAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGAcgc > 1:2942369/1‑71 (MQ=255) aaaaCTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTttgtt < 1:511326/60‑1 (MQ=255) aaaCTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGa > 1:992010/1‑66 (MQ=255) aCTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGtg > 1:4550787/1‑69 (MQ=255) aCTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTcc < 1:2022779/71‑1 (MQ=255) aCTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTcc < 1:4574101/71‑1 (MQ=255) cTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCg > 1:3188738/1‑71 (MQ=255) cACAAGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTg > 1:3815735‑M1/2‑71 (MQ=255) aacatgctgtgttgatgcaacgcatgttcaCCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTg > 1:259227‑M2/31‑71 (MQ=255) AACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCAGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTg > 1:3520292‑M1/1‑71 (MQ=255) ACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCg > 1:852111‑M1/1‑58 (MQ=255) TGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTttgt > 1:3254292‑M1/1‑48 (MQ=255) TGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGc < 1:3929580‑M1/71‑1 (MQ=255) gctgtgttgatgcaacgcatgttcaCCATTCTggtcggtc > 1:1624372‑M2/26‑40 (MQ=255) CGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGtttt < 1:403606‑M1/44‑1 (MQ=255) tgtgttgatgcaacgcatgttcaCCATTCTGGTCGGTCGTTttgt > 1:2183279‑M2/24‑45 (MQ=255) gTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCaa < 1:1185980/71‑1 (MQ=255) gTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCCAc > 1:3053172/1‑54 (MQ=255) ttGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGtttt < 1:359708/42‑1 (MQ=255) tGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAAtg > 1:3887472/1‑71 (MQ=255) aTCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGc < 1:1399424/57‑1 (MQ=255) aTCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAAtggtg > 1:5128293/1‑71 (MQ=255) aaCACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTttgt > 1:4061836/1‑37 (MQ=255) aaCACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTttgt > 1:1408702/1‑37 (MQ=255) aaCACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTgg > 1:4573074/1‑40 (MQ=255) aaCACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTgg > 1:4070011/1‑40 (MQ=255) aaCACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCg > 1:970409/1‑71 (MQ=255) aaCACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCg > 1:2254154/1‑71 (MQ=255) aaCACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCg > 1:1527819/1‑71 (MQ=255) acacAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGc < 1:945563/53‑1 (MQ=255) acacAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCgg < 1:882890/71‑1 (MQ=255) acaGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCggg > 1:4516584/1‑70 (MQ=255) acaGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGa < 1:1910950/71‑1 (MQ=255) caGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGaa > 1:1575146/1‑71 (MQ=255) aGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGa > 1:2543643/1‑40 (MQ=255) catgttcaCCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAAtg < 1:3950623‑M2/50‑1 (MQ=255) atgttcaCCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATGc < 1:2561461‑M2/63‑1 (MQ=255) gttcaCCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATGCTg < 1:354543‑M2/65‑1 (MQ=255) ttcaCCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATGCTgg < 1:114517‑M2/66‑1 (MQ=255) tcaCCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTc > 1:333216‑M2/4‑39 (MQ=255) aCCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATGCTGGATCt > 1:64152‑M2/2‑71 (MQ=255) aCCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATGCTGGATCt < 1:2603191‑M2/70‑1 (MQ=255) ccATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAAt > 1:1650642/1‑61 (MQ=255) | CATTTCTGAAGAAAAACAAAGCACTACTTGATAAAACTGAACATGCGTTGCATCAACACAGCATGTTCACCATTCTGGTCGGTCGTTTTGTTGGCCCGACGCGTCCGCTGGTGCCAATGGTGGCGGGAATGCTGGATCT > AP009048/71616‑71754 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |