| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Exported | = 205293 | NA (NA) | 6 (0.090) | 3/92 | NT | NA | noncoding (710/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA |
| ? | Exported | = 205316 | NA (NA) | noncoding (733/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA | |||||
AGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Exported/205220‑205293‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggttCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATAC < Exported/205316‑205247 AGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAG > 1:1659897/1‑71AGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAG < 1:4079441/71‑1 GTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGCCCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGG > 1:1446321/1‑71 GTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGG < 1:1071695/71‑1 TCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGT < 1:3001970/71‑1 TCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGT > 1:1041975/1‑71 TCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGT < 1:3294699/71‑1 TCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGT < 1:2335661/71‑1 TCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGT < 1:185794/71‑1 TCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGT > 1:1411038/1‑71 AACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTT < 1:3454408/68‑1 AACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTT < 1:4046591/68‑1 GGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGG < 1:40835/46‑1 TATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGT > 1:1033622/1‑45 TATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGT > 1:1268303/1‑45 TATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGT > 1:1220170/1‑45 GACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGG > 1:3455716/1‑40 CCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAG < 1:3812824/36‑1 CCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAG < 1:122711/36‑1 GAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGG > 1:611246/1‑35 CGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACC > 1:2438553/1‑58 ATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 1:3784734/49‑1 ATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCC < 1:2652598/49‑1 CTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAA > 1:4331944/1‑49 CTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAA > 1:879486/1‑49 CTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAA > 1:1507100/1‑49 GGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACGGGGTTTCGGGTCTA > 1:4367167/1‑71 GGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTA < 1:2912239/71‑1 GGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTA > 1:3416276/1‑71 GGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTA < 1:1921248/71‑1 GGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTA < 1:1713630/71‑1 GGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTA > 1:1756145/1‑71 GGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTA < 1:4021948/71‑1 GGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCAC > 1:2431057/1‑56 GGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAAC > 1:376064/1‑37 GTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTAT < 1:2806379/71‑1 GTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTAT < 1:1026448/71‑1 GTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTAT < 1:115626/71‑1 GTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTAT < 1:585249/71‑1 GTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTAT < 1:4356104/71‑1 GTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTAT < 1:1857013/71‑1 TTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATA < 1:2298044/71‑1 TTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATA > 1:2783097/1‑71 TTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTC < 1:3813521/67‑1 TTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTC < 1:1206513/67‑1 TTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGT > 1:2398194/1‑66 TTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGT > 1:2584755/1‑66 TCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATAC > 1:3659097/1‑71 TCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATAC > 1:4283480/1‑71 TCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATAC > 1:4354363/1‑71 TCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTC > 1:291273/1‑61 AGTCTTAACTGGGCGTTAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Exported/205220‑205293‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggttCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATAC < Exported/205316‑205247 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |